科学技术与工程
科學技術與工程
과학기술여공정
SCIENCE TECHNOLOGY AND ENGINEERING
2013年
1期
126-129,135
,共5页
混合核%支持向量机%microRNA前体
混閤覈%支持嚮量機%microRNA前體
혼합핵%지지향량궤%microRNA전체
MicroRNA是一种单链RNA小分子,是由具有发夹结构的、更长的单链RNA前体经加工后生成.相比microRNA序列本身而言,其前体序列和二级结构隐含了更多的可识别特征与信息.因此可利用加权Levenshtein距离,结合其前体序列和二级结构构造一个指数核函数.结合SVM构造识别模型,鉴别真假前体.在用5折叠法得到最佳识别模型后,对人类数据进行测试.实验结果显示,新方法表现出了较好的识别精度,和较高的敏感性与特异性.
MicroRNA是一種單鏈RNA小分子,是由具有髮夾結構的、更長的單鏈RNA前體經加工後生成.相比microRNA序列本身而言,其前體序列和二級結構隱含瞭更多的可識彆特徵與信息.因此可利用加權Levenshtein距離,結閤其前體序列和二級結構構造一箇指數覈函數.結閤SVM構造識彆模型,鑒彆真假前體.在用5摺疊法得到最佳識彆模型後,對人類數據進行測試.實驗結果顯示,新方法錶現齣瞭較好的識彆精度,和較高的敏感性與特異性.
MicroRNA시일충단련RNA소분자,시유구유발협결구적、경장적단련RNA전체경가공후생성.상비microRNA서렬본신이언,기전체서렬화이급결구은함료경다적가식별특정여신식.인차가이용가권Levenshtein거리,결합기전체서렬화이급결구구조일개지수핵함수.결합SVM구조식별모형,감별진가전체.재용5절첩법득도최가식별모형후,대인류수거진행측시.실험결과현시,신방법표현출료교호적식별정도,화교고적민감성여특이성.
