安徽大学学报(自然科学版)
安徽大學學報(自然科學版)
안휘대학학보(자연과학판)
JOURNAL OF ANHUI UNIVERSITY(NATURAL SCIENCES EDITION)
2013年
1期
67-72
,共6页
LoG矩阵%NMF%矩阵分解%基因表达谱
LoG矩陣%NMF%矩陣分解%基因錶達譜
LoG구진%NMF%구진분해%기인표체보
伴随着基因芯片的发展,通过研究海量的基因表达谱数据来识别肿瘤已成为生物信息学研究的热点.提出一种基于LoG(Laplace of Gaussian)矩阵分解的肿瘤基因特征提取方法,该方法首先将样本数据映射为高维空间中的点,然后构建点与点之间的LoG矩阵,在保留样本分类信息的情况下,使得无结构信息的基因表达谱数据变成具有结构信息的图,再对LoG权值矩阵进行非负矩阵分解得到能够表征样本特征的特征分量,最后用KNN对样本进行分类.通过对白血病和结肠癌基因表达谱数据的特征提取,验证该文方法的可行性和有效性.
伴隨著基因芯片的髮展,通過研究海量的基因錶達譜數據來識彆腫瘤已成為生物信息學研究的熱點.提齣一種基于LoG(Laplace of Gaussian)矩陣分解的腫瘤基因特徵提取方法,該方法首先將樣本數據映射為高維空間中的點,然後構建點與點之間的LoG矩陣,在保留樣本分類信息的情況下,使得無結構信息的基因錶達譜數據變成具有結構信息的圖,再對LoG權值矩陣進行非負矩陣分解得到能夠錶徵樣本特徵的特徵分量,最後用KNN對樣本進行分類.通過對白血病和結腸癌基因錶達譜數據的特徵提取,驗證該文方法的可行性和有效性.
반수착기인심편적발전,통과연구해량적기인표체보수거래식별종류이성위생물신식학연구적열점.제출일충기우LoG(Laplace of Gaussian)구진분해적종류기인특정제취방법,해방법수선장양본수거영사위고유공간중적점,연후구건점여점지간적LoG구진,재보류양본분류신식적정황하,사득무결구신식적기인표체보수거변성구유결구신식적도,재대LoG권치구진진행비부구진분해득도능구표정양본특정적특정분량,최후용KNN대양본진행분류.통과대백혈병화결장암기인표체보수거적특정제취,험증해문방법적가행성화유효성.