安徽农业科学
安徽農業科學
안휘농업과학
JOURNAL OF ANHUI AGRICULTURAL SCIENCES
2013年
8期
3294-3296,3361
,共4页
靳佩%解增言%蔡应繁%舒坤贤%黄飞飞
靳珮%解增言%蔡應繁%舒坤賢%黃飛飛
근패%해증언%채응번%서곤현%황비비
转座子%鉴别%注释%隐马尔柯夫模型%同源性%结构特征
轉座子%鑒彆%註釋%隱馬爾柯伕模型%同源性%結構特徵
전좌자%감별%주석%은마이가부모형%동원성%결구특정
转座子是一类可以在基因组不同位置间移动的、重复的序列,广泛存在于真核和原核生物基因组中,并对基因组的结构、功能和进化有着重要影响.转座子鉴别与注释是基因组注释工作的重要一步,相关软件可分为3类:从头算法、基于同源性的算法和联合算法,不同的软件实现方法和功能各不相同,并各有优缺点.文中对此进行了综述,并提出在今后的开发中将会出现更多结合多种算法的综合流程程序包,它们整合多种方法的优点,针对性强,可根据不同的需求来解决实际问题.
轉座子是一類可以在基因組不同位置間移動的、重複的序列,廣汎存在于真覈和原覈生物基因組中,併對基因組的結構、功能和進化有著重要影響.轉座子鑒彆與註釋是基因組註釋工作的重要一步,相關軟件可分為3類:從頭算法、基于同源性的算法和聯閤算法,不同的軟件實現方法和功能各不相同,併各有優缺點.文中對此進行瞭綜述,併提齣在今後的開髮中將會齣現更多結閤多種算法的綜閤流程程序包,它們整閤多種方法的優點,針對性彊,可根據不同的需求來解決實際問題.
전좌자시일류가이재기인조불동위치간이동적、중복적서렬,엄범존재우진핵화원핵생물기인조중,병대기인조적결구、공능화진화유착중요영향.전좌자감별여주석시기인조주석공작적중요일보,상관연건가분위3류:종두산법、기우동원성적산법화연합산법,불동적연건실현방법화공능각불상동,병각유우결점.문중대차진행료종술,병제출재금후적개발중장회출현경다결합다충산법적종합류정정서포,타문정합다충방법적우점,침대성강,가근거불동적수구래해결실제문제.
