天津医科大学学报
天津醫科大學學報
천진의과대학학보
JOURNAL OF TIANJIN MEDICAL UNIVERSITY
2013年
3期
192-195
,共4页
刘磊%马英%王润玲%王树青%徐为人
劉磊%馬英%王潤玲%王樹青%徐為人
류뢰%마영%왕윤령%왕수청%서위인
神经氨酸酶%流感病毒%计算机辅助药物设计%达菲%150-cavity
神經氨痠酶%流感病毒%計算機輔助藥物設計%達菲%150-cavity
신경안산매%류감병독%계산궤보조약물설계%체비%150-cavity
目的:虚拟筛选更高活性的神经氨酸酶(NA)抑制剂,提高抵抗变异病毒的能力,为以后相关疾病治疗新药的设计提供科学依据.方法:利用Schrodinger Suite2009中的Glide模块对Leadnow数据库进行高通量虚拟筛选,对选出的结构用“Core Hopping”模块改造结构;利用Desmond2.4软件包进行分子动力学模拟研究,将NA的空载蛋白及靶点与筛选结果较好的配体小分子复合物共3个模型分别进行10 ns的分子动力学模拟.结果:高通量虚拟筛选得到一个五元环结构的化合物ZINC 13219479,并以此为核心向150-cavity延伸,得到8个能很好进入的结构.建立了靶向这些位点的配体库,方便后续有关研究的进行.分子动力学结果表明模拟过程中各靶点与配体复合物体系稳定,结合位点正确.作为抑制剂,小分子配体与NA酶的150-cavity区域残基形成稳定的氢键作用,牢牢占据NA的催化位点.结论:通过计算机辅助设计得到的小分子与NA的结合能力理论上优于抑制剂达菲.在动力学模拟这些化合物后,更加确定了这些化合物的有效性,具有一定的科研价值.
目的:虛擬篩選更高活性的神經氨痠酶(NA)抑製劑,提高牴抗變異病毒的能力,為以後相關疾病治療新藥的設計提供科學依據.方法:利用Schrodinger Suite2009中的Glide模塊對Leadnow數據庫進行高通量虛擬篩選,對選齣的結構用“Core Hopping”模塊改造結構;利用Desmond2.4軟件包進行分子動力學模擬研究,將NA的空載蛋白及靶點與篩選結果較好的配體小分子複閤物共3箇模型分彆進行10 ns的分子動力學模擬.結果:高通量虛擬篩選得到一箇五元環結構的化閤物ZINC 13219479,併以此為覈心嚮150-cavity延伸,得到8箇能很好進入的結構.建立瞭靶嚮這些位點的配體庫,方便後續有關研究的進行.分子動力學結果錶明模擬過程中各靶點與配體複閤物體繫穩定,結閤位點正確.作為抑製劑,小分子配體與NA酶的150-cavity區域殘基形成穩定的氫鍵作用,牢牢佔據NA的催化位點.結論:通過計算機輔助設計得到的小分子與NA的結閤能力理論上優于抑製劑達菲.在動力學模擬這些化閤物後,更加確定瞭這些化閤物的有效性,具有一定的科研價值.
목적:허의사선경고활성적신경안산매(NA)억제제,제고저항변이병독적능력,위이후상관질병치료신약적설계제공과학의거.방법:이용Schrodinger Suite2009중적Glide모괴대Leadnow수거고진행고통량허의사선,대선출적결구용“Core Hopping”모괴개조결구;이용Desmond2.4연건포진행분자동역학모의연구,장NA적공재단백급파점여사선결과교호적배체소분자복합물공3개모형분별진행10 ns적분자동역학모의.결과:고통량허의사선득도일개오원배결구적화합물ZINC 13219479,병이차위핵심향150-cavity연신,득도8개능흔호진입적결구.건립료파향저사위점적배체고,방편후속유관연구적진행.분자동역학결과표명모의과정중각파점여배체복합물체계은정,결합위점정학.작위억제제,소분자배체여NA매적150-cavity구역잔기형성은정적경건작용,뢰뢰점거NA적최화위점.결론:통과계산궤보조설계득도적소분자여NA적결합능력이론상우우억제제체비.재동역학모의저사화합물후,경가학정료저사화합물적유효성,구유일정적과연개치.
