西北植物学报
西北植物學報
서북식물학보
ACTA BOTANICA BOREALI-OCCIDENTALIA SINICA
2013年
4期
684-691
,共8页
李景景%刘永峰%郭玉蓉%陈磊
李景景%劉永峰%郭玉蓉%陳磊
리경경%류영봉%곽옥용%진뢰
苹果%EIN2%克隆%序列分析
蘋果%EIN2%剋隆%序列分析
평과%EIN2%극륭%서렬분석
分别以苹果果实总DNA和cDNA为模板,采用PCR、RT-PCR方法扩增、克隆乙烯不敏感基因(ethylene insensitive 2,EIN2),并利用生物信息学方法分析其核苷酸序列和蛋白质结构.结果表明:(1)以DNA和cDNA为模板的扩增结果完全相同,扩增的EIN2基因片段为4 378 bp,尚未发现有内含子,开放阅读框全长3 282 bp,编码1 093个氨基酸；苹果EIN2相对分子质量为118.9 kD,等电点为5.52,其蛋白可能为脂溶性疏水蛋白.(2)所克隆苹果EIN2基因编码的氨基酸序列与拟南芥(AAD41077.1)、碧桃(ACY78397.1)和葡萄(CAN66374.1)EIN2基因编码的氨基酸序列一致性分别为52％ 、79％、62％.(3)构建的EIN2基因进化树显示,拟南芥、小盐芥、甜瓜、杨毛果EIN2基因亲缘关系较近,聚为一类；葡萄为一类；蒺藜苜蓿为一类；碧桃、矮牵牛、西红柿聚为一类；苹果单独为一类.而且苹果EIN2基因与碧桃等同源基因的亲缘关系相对较近,与拟南芥、小盐芥同源基因的亲缘关系相对较远.
分彆以蘋果果實總DNA和cDNA為模闆,採用PCR、RT-PCR方法擴增、剋隆乙烯不敏感基因(ethylene insensitive 2,EIN2),併利用生物信息學方法分析其覈苷痠序列和蛋白質結構.結果錶明:(1)以DNA和cDNA為模闆的擴增結果完全相同,擴增的EIN2基因片段為4 378 bp,尚未髮現有內含子,開放閱讀框全長3 282 bp,編碼1 093箇氨基痠；蘋果EIN2相對分子質量為118.9 kD,等電點為5.52,其蛋白可能為脂溶性疏水蛋白.(2)所剋隆蘋果EIN2基因編碼的氨基痠序列與擬南芥(AAD41077.1)、碧桃(ACY78397.1)和葡萄(CAN66374.1)EIN2基因編碼的氨基痠序列一緻性分彆為52％ 、79％、62％.(3)構建的EIN2基因進化樹顯示,擬南芥、小鹽芥、甜瓜、楊毛果EIN2基因親緣關繫較近,聚為一類；葡萄為一類；蒺藜苜蓿為一類；碧桃、矮牽牛、西紅柿聚為一類；蘋果單獨為一類.而且蘋果EIN2基因與碧桃等同源基因的親緣關繫相對較近,與擬南芥、小鹽芥同源基因的親緣關繫相對較遠.
분별이평과과실총DNA화cDNA위모판,채용PCR、RT-PCR방법확증、극륭을희불민감기인(ethylene insensitive 2,EIN2),병이용생물신식학방법분석기핵감산서렬화단백질결구.결과표명:(1)이DNA화cDNA위모판적확증결과완전상동,확증적EIN2기인편단위4 378 bp,상미발현유내함자,개방열독광전장3 282 bp,편마1 093개안기산；평과EIN2상대분자질량위118.9 kD,등전점위5.52,기단백가능위지용성소수단백.(2)소극륭평과EIN2기인편마적안기산서렬여의남개(AAD41077.1)、벽도(ACY78397.1)화포도(CAN66374.1)EIN2기인편마적안기산서렬일치성분별위52％ 、79％、62％.(3)구건적EIN2기인진화수현시,의남개、소염개、첨과、양모과EIN2기인친연관계교근,취위일류；포도위일류；질려목숙위일류；벽도、왜견우、서홍시취위일류；평과단독위일류.이차평과EIN2기인여벽도등동원기인적친연관계상대교근,여의남개、소염개동원기인적친연관계상대교원.
