东南大学学报（医学版）
東南大學學報（醫學版）
동남대학학보（의학판）
JOURNAL OF SOUTHEAST UNIVERSITY(MEDICAL SCIENCE EDITION)
2013年
1期
60-64
,共5页
has-miR-21%微小RNA%生物信息学
has-miR-21%微小RNA%生物信息學
has-miR-21%미소RNA%생물신식학
目的:观察人消化道肿瘤细胞株hsa-miR-21表达水平,通过生物信息学预测hsa-miR-21的靶基因,进一步分析其潜在功能,为其后续功能研究提供依据.方法:应用实时荧光定量PCR技术检测人胃癌细胞株AGS、人胆管癌细胞株QBC939、人食管鳞状细胞癌细胞株ECA109以及正常人食管上皮细胞株Het-1A中hsa-miR-21表达水平;应用pubmed检索hsa-miR-21已知相关文献;应用miRbase和NCBI数据库分析hsa-miR-21序列保守性和所在基因组特征;应用TargetScan、PicTar及miRanda预测hsa-miR-21的靶基因,并对其进行功能富集分析和信号转导通路富集分析.结果:(1) AGS、QBC939细胞株中hsa-miR-21表达水平显著上调,明显高于Het-1A细胞;(2) 已有研究证实hsa-miR-21与多种肿瘤相关;(3) miR-21在多个物种间具有序列保守性;(4) Hsa-miR-21靶基因主要参与转录调控、信号转导和Notch信号通路的正向调控等生物学过程,涉及Notch、细胞周期和轴突导向等信号转导通路.结论:hsa-miR-21可能通过调控多个信号通路参与消化道肿瘤的发病机制.
目的:觀察人消化道腫瘤細胞株hsa-miR-21錶達水平,通過生物信息學預測hsa-miR-21的靶基因,進一步分析其潛在功能,為其後續功能研究提供依據.方法:應用實時熒光定量PCR技術檢測人胃癌細胞株AGS、人膽管癌細胞株QBC939、人食管鱗狀細胞癌細胞株ECA109以及正常人食管上皮細胞株Het-1A中hsa-miR-21錶達水平;應用pubmed檢索hsa-miR-21已知相關文獻;應用miRbase和NCBI數據庫分析hsa-miR-21序列保守性和所在基因組特徵;應用TargetScan、PicTar及miRanda預測hsa-miR-21的靶基因,併對其進行功能富集分析和信號轉導通路富集分析.結果:(1) AGS、QBC939細胞株中hsa-miR-21錶達水平顯著上調,明顯高于Het-1A細胞;(2) 已有研究證實hsa-miR-21與多種腫瘤相關;(3) miR-21在多箇物種間具有序列保守性;(4) Hsa-miR-21靶基因主要參與轉錄調控、信號轉導和Notch信號通路的正嚮調控等生物學過程,涉及Notch、細胞週期和軸突導嚮等信號轉導通路.結論:hsa-miR-21可能通過調控多箇信號通路參與消化道腫瘤的髮病機製.
목적:관찰인소화도종류세포주hsa-miR-21표체수평,통과생물신식학예측hsa-miR-21적파기인,진일보분석기잠재공능,위기후속공능연구제공의거.방법:응용실시형광정량PCR기술검측인위암세포주AGS、인담관암세포주QBC939、인식관린상세포암세포주ECA109이급정상인식관상피세포주Het-1A중hsa-miR-21표체수평;응용pubmed검색hsa-miR-21이지상관문헌;응용miRbase화NCBI수거고분석hsa-miR-21서렬보수성화소재기인조특정;응용TargetScan、PicTar급miRanda예측hsa-miR-21적파기인,병대기진행공능부집분석화신호전도통로부집분석.결과:(1) AGS、QBC939세포주중hsa-miR-21표체수평현저상조,명현고우Het-1A세포;(2) 이유연구증실hsa-miR-21여다충종류상관;(3) miR-21재다개물충간구유서렬보수성;(4) Hsa-miR-21파기인주요삼여전록조공、신호전도화Notch신호통로적정향조공등생물학과정,섭급Notch、세포주기화축돌도향등신호전도통로.결론:hsa-miR-21가능통과조공다개신호통로삼여소화도종류적발병궤제.
