CAJ | 학술논문

对NCBI 数据库中210 878 条高粱EST 序列进行处理,得到57 498 条无冗余EST 序列,经SSR 搜索,发现3 338 个SSR 分布于3 116 条EST 序列中,分布频率为1/11.28 kb,包括215 种基元重复类型.其中三核苷酸重复最高,占68.33%,二核苷酸重复占17.97%.3 338 条SSR 序列中有1 694 条序列能够设计出引物,所占比例为50.75%.选取14 对引物进行合成,对50 份高丹草、7 份高粱和3 份苏丹草材料进行了EST-SSR 扩增,共检测到72 个等位变异,平均每对引物检测出5.14 个基因位点.每对引物多态性指数范围为0.54~0.93,遗传距离的变化范围0.1646~0.6398.结果显示:供试材料具有较丰富的遗传多样性,根据EST-SSR 数据的聚类分析,将供试材料按亲缘关系远近分为5 大类,来源相同的品种大致聚在一类,呈现出一定的地域性分布规律.同时发现4 个特异分子标记,其中引物D1763 只对314A 和白壳苏丹草杂交后代GB-4-2 高丹草审定品种产生特异性,此标记已作为该材料的特异性标记用于种质资源的鉴定中,同时表明,EST-SSR 标记是高丹草遗传多样性及特异性研究的一种有效方法.
대NCBI 수거고중210 878 조고량EST 서렬진행처리,득도57 498 조무용여EST 서렬,경SSR 수색,발현3 338 개SSR 분포우3 116 조EST 서렬중,분포빈솔위1/11.28 kb,포괄215 충기원중복류형.기중삼핵감산중복최고,점68.33%,이핵감산중복점17.97%.3 338 조SSR 서렬중유1 694 조서렬능구설계출인물,소점비례위50.75%.선취14 대인물진행합성,대50 빈고단초、7 빈고량화3 빈소단초재료진행료EST-SSR 확증,공검측도72 개등위변이,평균매대인물검측출5.14 개기인위점.매대인물다태성지수범위위0.54~0.93,유전거리적변화범위0.1646~0.6398.결과현시:공시재료구유교봉부적유전다양성,근거EST-SSR 수거적취류분석,장공시재료안친연관계원근분위5 대류,래원상동적품충대치취재일류,정현출일정적지역성분포규률.동시발현4 개특이분자표기,기중인물D1763 지대314A 화백각소단초잡교후대GB-4-2 고단초심정품충산생특이성,차표기이작위해재료적특이성표기용우충질자원적감정중,동시표명,EST-SSR 표기시고단초유전다양성급특이성연구적일충유효방법.