东南大学学报（医学版）
東南大學學報（醫學版）
동남대학학보（의학판）
JOURNAL OF SOUTHEAST UNIVERSITY(MEDICAL SCIENCE EDITION)
2013年
2期
173-179
,共7页
张建华%江炳福%程险峰%游贤惠%孟继鸿
張建華%江炳福%程險峰%遊賢惠%孟繼鴻
장건화%강병복%정험봉%유현혜%맹계홍
手足口病%肠道病毒71型%柯萨奇病毒A16型%VP1%基因特征
手足口病%腸道病毒71型%柯薩奇病毒A16型%VP1%基因特徵
수족구병%장도병독71형%가살기병독A16형%VP1%기인특정
目的:探讨苏皖地区手足口病(HFMD)患者肠道病毒71型(EV71)和柯萨奇病毒A16型(CA16)分离株的VP1基因特征.方法:采集南京市、马鞍山市2009至2010年HFMD患者临床标本进行病毒分离和RT-PCR鉴定;扩增并测定VP1基因序列;从GenBank中选取EV71和CA16不同基因型参考毒株,利用生物信息学软件进行同源性比对和系统进化树分析.结果:共分离到9株EV71和4株CA16,EV71分离株的核苷酸和氨基酸序列同源性分别为96.5% ～99.8%和99% ～100%;CA16分离株的核苷酸和氨基酸序列同源性为96.2% ～98.5%和99.3% ～100%;系统进化树分析显示,9株EV71全部属于C4a基因亚型,而4株CA16则全部属于B1b基因亚型.结论:2009至2010年苏皖地区分离到的EV71和CA16毒株分别属于C4a和B1b基因亚型,与国内其他地区HFMD病原学及分子进化研究结果一致,有望成为疫苗候选株作进一步研究.
目的:探討囌皖地區手足口病(HFMD)患者腸道病毒71型(EV71)和柯薩奇病毒A16型(CA16)分離株的VP1基因特徵.方法:採集南京市、馬鞍山市2009至2010年HFMD患者臨床標本進行病毒分離和RT-PCR鑒定;擴增併測定VP1基因序列;從GenBank中選取EV71和CA16不同基因型參攷毒株,利用生物信息學軟件進行同源性比對和繫統進化樹分析.結果:共分離到9株EV71和4株CA16,EV71分離株的覈苷痠和氨基痠序列同源性分彆為96.5% ～99.8%和99% ～100%;CA16分離株的覈苷痠和氨基痠序列同源性為96.2% ～98.5%和99.3% ～100%;繫統進化樹分析顯示,9株EV71全部屬于C4a基因亞型,而4株CA16則全部屬于B1b基因亞型.結論:2009至2010年囌皖地區分離到的EV71和CA16毒株分彆屬于C4a和B1b基因亞型,與國內其他地區HFMD病原學及分子進化研究結果一緻,有望成為疫苗候選株作進一步研究.
목적:탐토소환지구수족구병(HFMD)환자장도병독71형(EV71)화가살기병독A16형(CA16)분리주적VP1기인특정.방법:채집남경시、마안산시2009지2010년HFMD환자림상표본진행병독분리화RT-PCR감정;확증병측정VP1기인서렬;종GenBank중선취EV71화CA16불동기인형삼고독주,이용생물신식학연건진행동원성비대화계통진화수분석.결과:공분리도9주EV71화4주CA16,EV71분리주적핵감산화안기산서렬동원성분별위96.5% ～99.8%화99% ～100%;CA16분리주적핵감산화안기산서렬동원성위96.2% ～98.5%화99.3% ～100%;계통진화수분석현시,9주EV71전부속우C4a기인아형,이4주CA16칙전부속우B1b기인아형.결론:2009지2010년소환지구분리도적EV71화CA16독주분별속우C4a화B1b기인아형,여국내기타지구HFMD병원학급분자진화연구결과일치,유망성위역묘후선주작진일보연구.
