广东医学
廣東醫學
엄동의학
GUNAGDONG MEDICAL JOURNAL
2013年
4期
549-551
,共3页
曾军荣%王瑜玲%白培胜%李榕娇
曾軍榮%王瑜玲%白培勝%李榕嬌
증군영%왕유령%백배성%리용교
诺如病毒%流行病学%GⅡ-4基因型%广州从化地区
諾如病毒%流行病學%GⅡ-4基因型%廣州從化地區
낙여병독%류행병학%GⅡ-4기인형%엄주종화지구
目的 探讨广州从化地区诺如病毒分子流行病学特点,分析从化地区诺如病毒的基因型.方法 收集2011年1-12月从化地区腹泻患者标本218份,采用荧光RT-PCR对临床标本进行检测,同时针对诺如病毒ORF2基因区段设计引物,随机选取5株病毒进行ORF2基因序列测定.用ClustalW和MEGA5.0等软件进行序列特性分析和基因型分析.结果 218份临床标本中检测到38份阳性标本,检出率为17.43%.阳性率较高的月份为9、10、11、12月,全年最低检出率的时间为6、7月份(均为0),最高检出率的时间为11月份(32%).扩增了5株诺如病毒ORF2基因序列,序列分析发现与GenBank中GⅡ组诺如病毒的相似性为76%～98%,与GⅠ组为43%~55%,其中与GⅡ-4组Farmington Hills、Lorsdale、ShanghaiSH52009等株同源性为94%~98%,确认该5株诺如病毒属于GⅡ-4型.进一步的氨基酸序列分析发现与f亚型2006b新变株同源性为97%.结论 广州从化地区诺如病毒主要流行季节是冬季,克隆的5株诺如病毒属于GⅡ-4f 2006b型.2011年从化地区以GⅡ-4f 2006b新变异株为主要流行株.
目的 探討廣州從化地區諾如病毒分子流行病學特點,分析從化地區諾如病毒的基因型.方法 收集2011年1-12月從化地區腹瀉患者標本218份,採用熒光RT-PCR對臨床標本進行檢測,同時針對諾如病毒ORF2基因區段設計引物,隨機選取5株病毒進行ORF2基因序列測定.用ClustalW和MEGA5.0等軟件進行序列特性分析和基因型分析.結果 218份臨床標本中檢測到38份暘性標本,檢齣率為17.43%.暘性率較高的月份為9、10、11、12月,全年最低檢齣率的時間為6、7月份(均為0),最高檢齣率的時間為11月份(32%).擴增瞭5株諾如病毒ORF2基因序列,序列分析髮現與GenBank中GⅡ組諾如病毒的相似性為76%～98%,與GⅠ組為43%~55%,其中與GⅡ-4組Farmington Hills、Lorsdale、ShanghaiSH52009等株同源性為94%~98%,確認該5株諾如病毒屬于GⅡ-4型.進一步的氨基痠序列分析髮現與f亞型2006b新變株同源性為97%.結論 廣州從化地區諾如病毒主要流行季節是鼕季,剋隆的5株諾如病毒屬于GⅡ-4f 2006b型.2011年從化地區以GⅡ-4f 2006b新變異株為主要流行株.
목적 탐토엄주종화지구낙여병독분자류행병학특점,분석종화지구낙여병독적기인형.방법 수집2011년1-12월종화지구복사환자표본218빈,채용형광RT-PCR대림상표본진행검측,동시침대낙여병독ORF2기인구단설계인물,수궤선취5주병독진행ORF2기인서렬측정.용ClustalW화MEGA5.0등연건진행서렬특성분석화기인형분석.결과 218빈림상표본중검측도38빈양성표본,검출솔위17.43%.양성솔교고적월빈위9、10、11、12월,전년최저검출솔적시간위6、7월빈(균위0),최고검출솔적시간위11월빈(32%).확증료5주낙여병독ORF2기인서렬,서렬분석발현여GenBank중GⅡ조낙여병독적상사성위76%～98%,여GⅠ조위43%~55%,기중여GⅡ-4조Farmington Hills、Lorsdale、ShanghaiSH52009등주동원성위94%~98%,학인해5주낙여병독속우GⅡ-4형.진일보적안기산서렬분석발현여f아형2006b신변주동원성위97%.결론 엄주종화지구낙여병독주요류행계절시동계,극륭적5주낙여병독속우GⅡ-4f 2006b형.2011년종화지구이GⅡ-4f 2006b신변이주위주요류행주.
