中国动物传染病学报
中國動物傳染病學報
중국동물전염병학보
CHINESE JOURNAL OF VETERINARY PARASITOLOGY
2012年
3期
67-72
,共6页
王隆柏%吴学敏%车勇良%陈如敬%魏宏%刘玉涛%庄向生%周伦江
王隆柏%吳學敏%車勇良%陳如敬%魏宏%劉玉濤%莊嚮生%週倫江
왕륭백%오학민%차용량%진여경%위굉%류옥도%장향생%주륜강
猪流行性腹泻病毒%ORF3基因%M基因%序列分析
豬流行性腹瀉病毒%ORF3基因%M基因%序列分析
저류행성복사병독%ORF3기인%M기인%서렬분석
为了解福建省猪流行性腹泻病毒(Porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)毒株ORF3和M基因变异情况,本研究从4个不同规模猪场发生仔猪“顽固性腹泻”疾病的病料中扩增到4株PEDV的ORF3和M基因,并进行了序列分析.结果表明:4株PEDV ORF3基因均含有675个碱基,编码224个氨基酸,与GenBank中登录的代表性PEDV核苷酸的同源性为89.7％～100.0％,氨基酸的同源性为94.7％～99.6％,其中FJPT毒株核苷酸的同源性与CV777 truncated毒株最低,仅为89.7％,FJNP毒株核苷酸的同源性与中国北方流行的CH ZKFG 11毒株最高,达100.0％.M基因含有681个碱基,编码226个氨基酸,与GenBank中登录的代表性PEDV核苷酸的同源性为94.8％～100.0％,氨基酸的同源性为94.8％～99.6％,其中FJPT毒株核苷酸的同源性与日本D89752毒株最低,仅为94.8％,FJNP毒株核苷酸的同源性与韩国CPF193、泰国毒株最高,达100.0％.4株PEDV毒株均与国内外流行强毒株的亲缘关系较近,与attenuate DR13弱毒株的亲缘关系较远.
為瞭解福建省豬流行性腹瀉病毒(Porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)毒株ORF3和M基因變異情況,本研究從4箇不同規模豬場髮生仔豬“頑固性腹瀉”疾病的病料中擴增到4株PEDV的ORF3和M基因,併進行瞭序列分析.結果錶明:4株PEDV ORF3基因均含有675箇堿基,編碼224箇氨基痠,與GenBank中登錄的代錶性PEDV覈苷痠的同源性為89.7％～100.0％,氨基痠的同源性為94.7％～99.6％,其中FJPT毒株覈苷痠的同源性與CV777 truncated毒株最低,僅為89.7％,FJNP毒株覈苷痠的同源性與中國北方流行的CH ZKFG 11毒株最高,達100.0％.M基因含有681箇堿基,編碼226箇氨基痠,與GenBank中登錄的代錶性PEDV覈苷痠的同源性為94.8％～100.0％,氨基痠的同源性為94.8％～99.6％,其中FJPT毒株覈苷痠的同源性與日本D89752毒株最低,僅為94.8％,FJNP毒株覈苷痠的同源性與韓國CPF193、泰國毒株最高,達100.0％.4株PEDV毒株均與國內外流行彊毒株的親緣關繫較近,與attenuate DR13弱毒株的親緣關繫較遠.
위료해복건성저류행성복사병독(Porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)독주ORF3화M기인변이정황,본연구종4개불동규모저장발생자저“완고성복사”질병적병료중확증도4주PEDV적ORF3화M기인,병진행료서렬분석.결과표명:4주PEDV ORF3기인균함유675개감기,편마224개안기산,여GenBank중등록적대표성PEDV핵감산적동원성위89.7％～100.0％,안기산적동원성위94.7％～99.6％,기중FJPT독주핵감산적동원성여CV777 truncated독주최저,부위89.7％,FJNP독주핵감산적동원성여중국북방류행적CH ZKFG 11독주최고,체100.0％.M기인함유681개감기,편마226개안기산,여GenBank중등록적대표성PEDV핵감산적동원성위94.8％～100.0％,안기산적동원성위94.8％～99.6％,기중FJPT독주핵감산적동원성여일본D89752독주최저,부위94.8％,FJNP독주핵감산적동원성여한국CPF193、태국독주최고,체100.0％.4주PEDV독주균여국내외류행강독주적친연관계교근,여attenuate DR13약독주적친연관계교원.
