华北农学报
華北農學報
화북농학보
ACTA AGRICULTURAE BOREALI-SINICA
2013年
1期
117-122
,共6页
王俊斌%李明%丁博%包曙光%王锐%谢晓东
王俊斌%李明%丁博%包曙光%王銳%謝曉東
왕준빈%리명%정박%포서광%왕예%사효동
小麦%磷脂酶Dα%基因克隆%生物信息学
小麥%燐脂酶Dα%基因剋隆%生物信息學
소맥%린지매Dα%기인극륭%생물신식학
为获得更多小麦抗逆基因资源,利用RT-PCR方法克隆了磷脂酶D基因(PLD),命名为TaPLDα,并对基因及其蛋白进行了生物信息学分析.结果表明,TaPLDα开放阅读框为2 394 bp,编码812个氨基酸残基,等电点5.30,分子量为92 kDa.序列分析显示,TaPLDα基因编码的氨基酸序列含有N端C2结构域及2个保守的活性中心.预测TaPLDα蛋白是一个亲水性稳定蛋白且定位于细胞质,其二级结构含28.82％的α-螺旋、20.07％的延伸链、6.03％的B-转角和45.07％的不规则卷曲.该蛋白不存在信号肽,无跨膜区.TaPLDα与水稻、玉米和拟南芥的PLDα氨基酸序列之间具有高度的保守性,进化分析显示,小麦PLDα序列与毒麦、水稻和玉米PLD序列亲缘关系密切.
為穫得更多小麥抗逆基因資源,利用RT-PCR方法剋隆瞭燐脂酶D基因(PLD),命名為TaPLDα,併對基因及其蛋白進行瞭生物信息學分析.結果錶明,TaPLDα開放閱讀框為2 394 bp,編碼812箇氨基痠殘基,等電點5.30,分子量為92 kDa.序列分析顯示,TaPLDα基因編碼的氨基痠序列含有N耑C2結構域及2箇保守的活性中心.預測TaPLDα蛋白是一箇親水性穩定蛋白且定位于細胞質,其二級結構含28.82％的α-螺鏇、20.07％的延伸鏈、6.03％的B-轉角和45.07％的不規則捲麯.該蛋白不存在信號肽,無跨膜區.TaPLDα與水稻、玉米和擬南芥的PLDα氨基痠序列之間具有高度的保守性,進化分析顯示,小麥PLDα序列與毒麥、水稻和玉米PLD序列親緣關繫密切.
위획득경다소맥항역기인자원,이용RT-PCR방법극륭료린지매D기인(PLD),명명위TaPLDα,병대기인급기단백진행료생물신식학분석.결과표명,TaPLDα개방열독광위2 394 bp,편마812개안기산잔기,등전점5.30,분자량위92 kDa.서렬분석현시,TaPLDα기인편마적안기산서렬함유N단C2결구역급2개보수적활성중심.예측TaPLDα단백시일개친수성은정단백차정위우세포질,기이급결구함28.82％적α-라선、20.07％적연신련、6.03％적B-전각화45.07％적불규칙권곡.해단백불존재신호태,무과막구.TaPLDα여수도、옥미화의남개적PLDα안기산서렬지간구유고도적보수성,진화분석현시,소맥PLDα서렬여독맥、수도화옥미PLD서렬친연관계밀절.
