安徽农业科学
安徽農業科學
안휘농업과학
JOURNAL OF ANHUI AGRICULTURAL SCIENCES
2013年
2期
640-641,700
,共3页
谢毅%牟一娇%朱琳%刘强%赵兴绪
謝毅%牟一嬌%硃琳%劉彊%趙興緒
사의%모일교%주림%류강%조흥서
口蹄疫病毒%A/HeN/1/2009株%全基因组%东南亚拓扑型
口蹄疫病毒%A/HeN/1/2009株%全基因組%東南亞拓撲型
구제역병독%A/HeN/1/2009주%전기인조%동남아탁복형
[目的]测定A型口蹄疫病毒A/HeN/1/2009株全基因组序列并分析其基因特征,为研究我国最近发生的A型口蹄疫病毒的致病性、流行规律以及筛选适用的疫情防控疫苗株奠定分子基础.[方法]应用RT-PCR方法,分段扩增、克隆A/HeN/1/2009株基因,并进行基因测序;借助DNAStar分子生物学软件,从分子流行病学角度分析A/HeN/1/2009株与参考毒株之间可能的遗传衍化关系.[结果]该毒株基因组全长8 171 nts[不包括poly(C)区段和poly(A)尾巴],其中5'-UTR和3'-UTR分别为1 080、92nts,蛋白编码区为6 999 nts.分析A/HeN/1/2009株遗传衍化关系显示,该毒株划为东南亚拓扑型Laos03系的VN09亚系,同源性依次为87.3% ~ 91.8%、93.7% ~94.5%和96.9%~98.4%.[结论]VP1中A24V、N85R、S196T,3A中I61V、T128S、E147G和A134V在该毒群的进化过程中扮演重要角色;A/SH/1/2009株VP1 140-160基序为RSD.
[目的]測定A型口蹄疫病毒A/HeN/1/2009株全基因組序列併分析其基因特徵,為研究我國最近髮生的A型口蹄疫病毒的緻病性、流行規律以及篩選適用的疫情防控疫苗株奠定分子基礎.[方法]應用RT-PCR方法,分段擴增、剋隆A/HeN/1/2009株基因,併進行基因測序;藉助DNAStar分子生物學軟件,從分子流行病學角度分析A/HeN/1/2009株與參攷毒株之間可能的遺傳衍化關繫.[結果]該毒株基因組全長8 171 nts[不包括poly(C)區段和poly(A)尾巴],其中5'-UTR和3'-UTR分彆為1 080、92nts,蛋白編碼區為6 999 nts.分析A/HeN/1/2009株遺傳衍化關繫顯示,該毒株劃為東南亞拓撲型Laos03繫的VN09亞繫,同源性依次為87.3% ~ 91.8%、93.7% ~94.5%和96.9%~98.4%.[結論]VP1中A24V、N85R、S196T,3A中I61V、T128S、E147G和A134V在該毒群的進化過程中扮縯重要角色;A/SH/1/2009株VP1 140-160基序為RSD.
[목적]측정A형구제역병독A/HeN/1/2009주전기인조서렬병분석기기인특정,위연구아국최근발생적A형구제역병독적치병성、류행규률이급사선괄용적역정방공역묘주전정분자기출.[방법]응용RT-PCR방법,분단확증、극륭A/HeN/1/2009주기인,병진행기인측서;차조DNAStar분자생물학연건,종분자류행병학각도분석A/HeN/1/2009주여삼고독주지간가능적유전연화관계.[결과]해독주기인조전장8 171 nts[불포괄poly(C)구단화poly(A)미파],기중5'-UTR화3'-UTR분별위1 080、92nts,단백편마구위6 999 nts.분석A/HeN/1/2009주유전연화관계현시,해독주화위동남아탁복형Laos03계적VN09아계,동원성의차위87.3% ~ 91.8%、93.7% ~94.5%화96.9%~98.4%.[결론]VP1중A24V、N85R、S196T,3A중I61V、T128S、E147G화A134V재해독군적진화과정중분연중요각색;A/SH/1/2009주VP1 140-160기서위RSD.