CAJ | 학술논문

通过印度尼西亚苏门答腊岛Padang Cermin热泉环境基因组DNA构建古菌16S rRNA基因文库,并利用PCR-RFLP技术对其古菌多样性和系统发育分析进行了研究.根据限制性内切酶AluⅠ和MspⅠ的特征性酶切图谱,将62个阳性克隆归类为14个分类操作单位(operational taxonomic unit,OTU),文库的覆盖度达90.32％.克隆文库的优势类群为OTU2和OTU1,分别占克隆文库的27.42％和20.96％.从每个OUT中选取一个代表性克隆进行16S rRNA基因的序列测定与系统发育分析,结果表明,测定的Padang Cermin热泉中的古菌均属于泉古菌门,包括热变形菌目(Thermoproteales)、硫还原球菌目(Desulfurococcales)、杂色泉古菌(miscellaneous crenarchaeotic group,MCG)和未培养泉古菌(uncultured Crenarchaeota,UC),该热泉代表性克隆与GenBank数据库已有16S rRNA序列的相似性为91.9％～97.8％,而且与其相似性最高的序列均来自未培养的古菌克隆,由结果可见,Padang Cermin热泉古菌群落与已报道的其他热泉古菌群落的相似性较低,表明该热泉可能具有某些独特的特征,存在着特殊的古菌生态类群.
통과인도니서아소문답석도Padang Cermin열천배경기인조DNA구건고균16S rRNA기인문고,병이용PCR-RFLP기술대기고균다양성화계통발육분석진행료연구.근거한제성내절매AluⅠ화MspⅠ적특정성매절도보,장62개양성극륭귀류위14개분류조작단위(operational taxonomic unit,OTU),문고적복개도체90.32％.극륭문고적우세류군위OTU2화OTU1,분별점극륭문고적27.42％화20.96％.종매개OUT중선취일개대표성극륭진행16S rRNA기인적서렬측정여계통발육분석,결과표명,측정적Padang Cermin열천중적고균균속우천고균문,포괄열변형균목(Thermoproteales)、류환원구균목(Desulfurococcales)、잡색천고균(miscellaneous crenarchaeotic group,MCG)화미배양천고균(uncultured Crenarchaeota,UC),해열천대표성극륭여GenBank수거고이유16S rRNA서렬적상사성위91.9％～97.8％,이차여기상사성최고적서렬균래자미배양적고균극륭,유결과가견,Padang Cermin열천고균군락여이보도적기타열천고균군락적상사성교저,표명해열천가능구유모사독특적특정,존재착특수적고균생태류군.