林业科学
林業科學
임업과학
SCIENTIA SILVAE SINICAE
2013年
1期
68-76
,共9页
黄平%崔娇鹏%郑勇奇%张川红
黃平%崔嬌鵬%鄭勇奇%張川紅
황평%최교붕%정용기%장천홍
月季%品种%多倍体%微卫星标记%遗传相似系数%聚类分析
月季%品種%多倍體%微衛星標記%遺傳相似繫數%聚類分析
월계%품충%다배체%미위성표기%유전상사계수%취류분석
以月季品种的微卫星标记数据为基础,选择7个遗传相似系数对月季品种间遗传相似度进行计算,并采用非加权组平均法(UPGMA)建立相应的系统树.通过遗传相似系数相关性、聚类结果一致性以及拟合优度等分析方法,探讨不同的遗传相似系数在微卫星遗传分析中的适用性.分析数据显示7个系数之间相关系数介于0.726 ~1.000.共表型相关系数rc介于0.85~0.93,表明品种间遗传差异在基于UPGMA方法的聚类树状图中有良好体现.系统树之间的CI.指数范围为0.468 ~1.000,表明采用不同相似系数进行聚类分析时,结果存在较大差异.7个遗传相似系数的S统计值介于16.24% ~ 29.90%,Russel and Rao系数最低,Simple Matching等3个系数S值均大于20%.综合考虑分子标记特点、物种杂合度、Kruskal拟合优度等因素,并结合聚类分析与品种谱系比较结果,研究认为Dice系数和Jaccard系数适用于月季的微卫星遗传分析,其次是Simple Matching系数.
以月季品種的微衛星標記數據為基礎,選擇7箇遺傳相似繫數對月季品種間遺傳相似度進行計算,併採用非加權組平均法(UPGMA)建立相應的繫統樹.通過遺傳相似繫數相關性、聚類結果一緻性以及擬閤優度等分析方法,探討不同的遺傳相似繫數在微衛星遺傳分析中的適用性.分析數據顯示7箇繫數之間相關繫數介于0.726 ~1.000.共錶型相關繫數rc介于0.85~0.93,錶明品種間遺傳差異在基于UPGMA方法的聚類樹狀圖中有良好體現.繫統樹之間的CI.指數範圍為0.468 ~1.000,錶明採用不同相似繫數進行聚類分析時,結果存在較大差異.7箇遺傳相似繫數的S統計值介于16.24% ~ 29.90%,Russel and Rao繫數最低,Simple Matching等3箇繫數S值均大于20%.綜閤攷慮分子標記特點、物種雜閤度、Kruskal擬閤優度等因素,併結閤聚類分析與品種譜繫比較結果,研究認為Dice繫數和Jaccard繫數適用于月季的微衛星遺傳分析,其次是Simple Matching繫數.
이월계품충적미위성표기수거위기출,선택7개유전상사계수대월계품충간유전상사도진행계산,병채용비가권조평균법(UPGMA)건립상응적계통수.통과유전상사계수상관성、취류결과일치성이급의합우도등분석방법,탐토불동적유전상사계수재미위성유전분석중적괄용성.분석수거현시7개계수지간상관계수개우0.726 ~1.000.공표형상관계수rc개우0.85~0.93,표명품충간유전차이재기우UPGMA방법적취류수상도중유량호체현.계통수지간적CI.지수범위위0.468 ~1.000,표명채용불동상사계수진행취류분석시,결과존재교대차이.7개유전상사계수적S통계치개우16.24% ~ 29.90%,Russel and Rao계수최저,Simple Matching등3개계수S치균대우20%.종합고필분자표기특점、물충잡합도、Kruskal의합우도등인소,병결합취류분석여품충보계비교결과,연구인위Dice계수화Jaccard계수괄용우월계적미위성유전분석,기차시Simple Matching계수.