植物遗传资源学报
植物遺傳資源學報
식물유전자원학보
JOURNAL OF PLANT GENETLC RESOURCES
2013年
2期
237-242
,共6页
高伟%王坤波%刘方%王春英%张香娣%王玉红%黎绍惠
高偉%王坤波%劉方%王春英%張香娣%王玉紅%黎紹惠
고위%왕곤파%류방%왕춘영%장향제%왕옥홍%려소혜
陆地棉%野生种系%SSR%引物%多态性位点%聚类
陸地棉%野生種繫%SSR%引物%多態性位點%聚類
륙지면%야생충계%SSR%인물%다태성위점%취류
利用SSR标记分析陆地棉野生种系的遗传多样性,对材料间相似系数的变异系数进行显著性测验和矩阵相关性测验,探讨引物和多态性位点数对研究结果准确性的影响.90对多态性引物在42份供试材料间共检测出530个等位位点,其中多态性位点440个,占83.01%.多态信息含量范围为0.046 ~0.888,平均为0.649;Shannon多样性指数在0.113~2.289之间变动,平均为1.248.显著性测验显示,当引物按PIC值降序排列时,利用25对引物或者150个多态性位点即可获得较准确的结果;升序排列时,至少需要50对引物或200个多态性位点才能获得较准确的结果.矩阵相关性测验显示,降序时20对、升序时50对引物或者达到150个多态性位点聚类即可达到90对引物时的精度.此外,在引物量较少时,扩增位点数较多的引物所提供的信息量更大,随着引物量的增加,这种差距趋于不明显;等位位点总数较少时,引物数量更重要,随着位点数的增加,引物信息含量的重要性已高于引物数起主导作用.综上,若要客观反映出42份陆地棉野生种系的遗传关系,有必要选用多态性引物30对,扩增多态性位点150个以上,增加引物到50对以上为佳.
利用SSR標記分析陸地棉野生種繫的遺傳多樣性,對材料間相似繫數的變異繫數進行顯著性測驗和矩陣相關性測驗,探討引物和多態性位點數對研究結果準確性的影響.90對多態性引物在42份供試材料間共檢測齣530箇等位位點,其中多態性位點440箇,佔83.01%.多態信息含量範圍為0.046 ~0.888,平均為0.649;Shannon多樣性指數在0.113~2.289之間變動,平均為1.248.顯著性測驗顯示,噹引物按PIC值降序排列時,利用25對引物或者150箇多態性位點即可穫得較準確的結果;升序排列時,至少需要50對引物或200箇多態性位點纔能穫得較準確的結果.矩陣相關性測驗顯示,降序時20對、升序時50對引物或者達到150箇多態性位點聚類即可達到90對引物時的精度.此外,在引物量較少時,擴增位點數較多的引物所提供的信息量更大,隨著引物量的增加,這種差距趨于不明顯;等位位點總數較少時,引物數量更重要,隨著位點數的增加,引物信息含量的重要性已高于引物數起主導作用.綜上,若要客觀反映齣42份陸地棉野生種繫的遺傳關繫,有必要選用多態性引物30對,擴增多態性位點150箇以上,增加引物到50對以上為佳.
이용SSR표기분석륙지면야생충계적유전다양성,대재료간상사계수적변이계수진행현저성측험화구진상관성측험,탐토인물화다태성위점수대연구결과준학성적영향.90대다태성인물재42빈공시재료간공검측출530개등위위점,기중다태성위점440개,점83.01%.다태신식함량범위위0.046 ~0.888,평균위0.649;Shannon다양성지수재0.113~2.289지간변동,평균위1.248.현저성측험현시,당인물안PIC치강서배렬시,이용25대인물혹자150개다태성위점즉가획득교준학적결과;승서배렬시,지소수요50대인물혹200개다태성위점재능획득교준학적결과.구진상관성측험현시,강서시20대、승서시50대인물혹자체도150개다태성위점취류즉가체도90대인물시적정도.차외,재인물량교소시,확증위점수교다적인물소제공적신식량경대,수착인물량적증가,저충차거추우불명현;등위위점총수교소시,인물수량경중요,수착위점수적증가,인물신식함량적중요성이고우인물수기주도작용.종상,약요객관반영출42빈륙지면야생충계적유전관계,유필요선용다태성인물30대,확증다태성위점150개이상,증가인물도50대이상위가.