黑龙江大学工程学报
黑龍江大學工程學報
흑룡강대학공정학보
JOURNAL OF HEILONGJIANG HYDRAULIC ENGINEERING COLLEGE
2013年
4期
40-46
,共7页
李萍艳%王迎晨%袁晓辉%田文静
李萍豔%王迎晨%袁曉輝%田文靜
리평염%왕영신%원효휘%전문정
流行性感冒病毒%血凝素%同源建模%分子进化
流行性感冒病毒%血凝素%同源建模%分子進化
류행성감모병독%혈응소%동원건모%분자진화
血凝素是流感病毒主要的中和抗原,也是流感病毒分型依据之一.为研究人感染甲型H7N9亚型禽流感病毒血凝素的结构特征和进化历史,从GenBank和GISAID数据库获取人感染甲型H7N9亚型禽流感病毒的血凝素序列数据,用BLAS7检索和分层抽样方法分别选取参比序列,进行多重序列比对,构建基于血凝素氨基酸序列的进化树.选取A/Shanghai/02/2013株为代表序列,用同源建模方法构建血凝素蛋白质三维结构模型,分别计算序列比对结果中各氨基酸残基同分类指标的互信息并投射到构建三维结构模型,观察代表性残基的分布趋势.结果表明各新发毒株的血凝素高度相似,且同我国浙江地区分离到毒株最为接近,新发毒株的代表性氨基酸残基主要分布在血凝素的头部表面.
血凝素是流感病毒主要的中和抗原,也是流感病毒分型依據之一.為研究人感染甲型H7N9亞型禽流感病毒血凝素的結構特徵和進化歷史,從GenBank和GISAID數據庫穫取人感染甲型H7N9亞型禽流感病毒的血凝素序列數據,用BLAS7檢索和分層抽樣方法分彆選取參比序列,進行多重序列比對,構建基于血凝素氨基痠序列的進化樹.選取A/Shanghai/02/2013株為代錶序列,用同源建模方法構建血凝素蛋白質三維結構模型,分彆計算序列比對結果中各氨基痠殘基同分類指標的互信息併投射到構建三維結構模型,觀察代錶性殘基的分佈趨勢.結果錶明各新髮毒株的血凝素高度相似,且同我國浙江地區分離到毒株最為接近,新髮毒株的代錶性氨基痠殘基主要分佈在血凝素的頭部錶麵.
혈응소시류감병독주요적중화항원,야시류감병독분형의거지일.위연구인감염갑형H7N9아형금류감병독혈응소적결구특정화진화역사,종GenBank화GISAID수거고획취인감염갑형H7N9아형금류감병독적혈응소서렬수거,용BLAS7검색화분층추양방법분별선취삼비서렬,진행다중서렬비대,구건기우혈응소안기산서렬적진화수.선취A/Shanghai/02/2013주위대표서렬,용동원건모방법구건혈응소단백질삼유결구모형,분별계산서렬비대결과중각안기산잔기동분류지표적호신식병투사도구건삼유결구모형,관찰대표성잔기적분포추세.결과표명각신발독주적혈응소고도상사,차동아국절강지구분리도독주최위접근,신발독주적대표성안기산잔기주요분포재혈응소적두부표면.
