中国动物传染病学报
中國動物傳染病學報
중국동물전염병학보
CHINESE JOURNAL OF VETERINARY PARASITOLOGY
2013年
1期
29-36
,共8页
杜杰%尹惠琼%杨姝%马玉媛%韦平%章金刚
杜傑%尹惠瓊%楊姝%馬玉媛%韋平%章金剛
두걸%윤혜경%양주%마옥원%위평%장금강
蓝舌病毒VP7蛋白%B淋巴细胞表位%二级结构%预测
藍舌病毒VP7蛋白%B淋巴細胞錶位%二級結構%預測
람설병독VP7단백%B림파세포표위%이급결구%예측
根据前期试验中测得的蓝舌病病毒VP7蛋白的基因序列和推导的氨基酸序列,利用DNAStar软件和Biosun软件进行生物信息学预测,以单参数(亲水性、可及性、柔韧性、抗原性)预测为基础,结合二级结构预测来综合分析蓝舌病病毒VP7蛋白的B细胞表位.比较两种软件的预测结果发现,在蓝舌病病毒VP7蛋白的381个氨基酸序列中,第81～85、198～202、235～239、253～257区域有较好的亲水性、表面可及性和较高的抗原指数,并且在二级结构上含有易形成抗原表位的转角和无规则卷曲,最有可能为蓝舌病病毒VP7蛋白的B细胞线性优势表位.上述预测和判定结果表明,在蓝舌病病毒VP7蛋白序列中存在优势B细胞线型表位,为进一步合成多肽并分析已获得的VP7蛋白单抗的结合表位奠定了基础.
根據前期試驗中測得的藍舌病病毒VP7蛋白的基因序列和推導的氨基痠序列,利用DNAStar軟件和Biosun軟件進行生物信息學預測,以單參數(親水性、可及性、柔韌性、抗原性)預測為基礎,結閤二級結構預測來綜閤分析藍舌病病毒VP7蛋白的B細胞錶位.比較兩種軟件的預測結果髮現,在藍舌病病毒VP7蛋白的381箇氨基痠序列中,第81～85、198～202、235～239、253～257區域有較好的親水性、錶麵可及性和較高的抗原指數,併且在二級結構上含有易形成抗原錶位的轉角和無規則捲麯,最有可能為藍舌病病毒VP7蛋白的B細胞線性優勢錶位.上述預測和判定結果錶明,在藍舌病病毒VP7蛋白序列中存在優勢B細胞線型錶位,為進一步閤成多肽併分析已穫得的VP7蛋白單抗的結閤錶位奠定瞭基礎.
근거전기시험중측득적람설병병독VP7단백적기인서렬화추도적안기산서렬,이용DNAStar연건화Biosun연건진행생물신식학예측,이단삼수(친수성、가급성、유인성、항원성)예측위기출,결합이급결구예측래종합분석람설병병독VP7단백적B세포표위.비교량충연건적예측결과발현,재람설병병독VP7단백적381개안기산서렬중,제81～85、198～202、235～239、253～257구역유교호적친수성、표면가급성화교고적항원지수,병차재이급결구상함유역형성항원표위적전각화무규칙권곡,최유가능위람설병병독VP7단백적B세포선성우세표위.상술예측화판정결과표명,재람설병병독VP7단백서렬중존재우세B세포선형표위,위진일보합성다태병분석이획득적VP7단백단항적결합표위전정료기출.
