中国肺癌杂志
中國肺癌雜誌
중국폐암잡지
CHINESE JOURNAL OF LUNG CANCER
2012年
11期
642-645
,共4页
王俊龙%石俊杰%刘文洲%孙宇%周华富
王俊龍%石俊傑%劉文洲%孫宇%週華富
왕준룡%석준걸%류문주%손우%주화부
肺肿瘤%基因富集%Meta分析%关键基因%紧密连接通路
肺腫瘤%基因富集%Meta分析%關鍵基因%緊密連接通路
폐종류%기인부집%Meta분석%관건기인%긴밀련접통로
背景与目的 肺癌是最常见的恶性肿瘤之一.对于肺癌基因芯片的研究已在很多报道里提及,但是鲜有报道汇总所有的基因芯片数据来研究肺癌的共同表达通路从而挖掘出特殊的基因标记来作为治疗肺癌的靶点.本研究从肺癌相关的基因芯片数据库(GEO DataSets)中初步筛选出与肺癌发生发展有关键联系的基因与通路.方法 运用基因富集(gene set enrichment analysis,GSEA)等生物信息学方法比较选择出的6套肺癌基因芯片表达谱数据,初步筛选出在转录水平上影响肺癌的通路及基因.结果 用GSEA方法分析6组芯片集中所得的通路对比,上调中皆有的通路有3条;下调中皆有的通路有26条.本研究挑选共同存在于6套芯片数据集的下凋通路即紧密连接(tight junction)通路里的基因进行meta分析,可得差异有统计学意义(P<0.05)的基因11个.结论 紧密连接通路在肺癌发生发展过程中的共性可能有一定研究意义,可在后续研究中探讨通路里的显著性基因.
揹景與目的 肺癌是最常見的噁性腫瘤之一.對于肺癌基因芯片的研究已在很多報道裏提及,但是鮮有報道彙總所有的基因芯片數據來研究肺癌的共同錶達通路從而挖掘齣特殊的基因標記來作為治療肺癌的靶點.本研究從肺癌相關的基因芯片數據庫(GEO DataSets)中初步篩選齣與肺癌髮生髮展有關鍵聯繫的基因與通路.方法 運用基因富集(gene set enrichment analysis,GSEA)等生物信息學方法比較選擇齣的6套肺癌基因芯片錶達譜數據,初步篩選齣在轉錄水平上影響肺癌的通路及基因.結果 用GSEA方法分析6組芯片集中所得的通路對比,上調中皆有的通路有3條;下調中皆有的通路有26條.本研究挑選共同存在于6套芯片數據集的下凋通路即緊密連接(tight junction)通路裏的基因進行meta分析,可得差異有統計學意義(P<0.05)的基因11箇.結論 緊密連接通路在肺癌髮生髮展過程中的共性可能有一定研究意義,可在後續研究中探討通路裏的顯著性基因.
배경여목적 폐암시최상견적악성종류지일.대우폐암기인심편적연구이재흔다보도리제급,단시선유보도회총소유적기인심편수거래연구폐암적공동표체통로종이알굴출특수적기인표기래작위치료폐암적파점.본연구종폐암상관적기인심편수거고(GEO DataSets)중초보사선출여폐암발생발전유관건련계적기인여통로.방법 운용기인부집(gene set enrichment analysis,GSEA)등생물신식학방법비교선택출적6투폐암기인심편표체보수거,초보사선출재전록수평상영향폐암적통로급기인.결과 용GSEA방법분석6조심편집중소득적통로대비,상조중개유적통로유3조;하조중개유적통로유26조.본연구도선공동존재우6투심편수거집적하조통로즉긴밀련접(tight junction)통로리적기인진행meta분석,가득차이유통계학의의(P<0.05)적기인11개.결론 긴밀련접통로재폐암발생발전과정중적공성가능유일정연구의의,가재후속연구중탐토통로리적현저성기인.