中国人兽共患病学报
中國人獸共患病學報
중국인수공환병학보
CHINESE JOURNAL OF ZOONOSES
2013年
3期
262-266,273
,共6页
章乐怡%李毅%郑文力%马雪莲
章樂怡%李毅%鄭文力%馬雪蓮
장악이%리의%정문력%마설련
嗜肺军团菌%序列分型%聚类分析%管家基因
嗜肺軍糰菌%序列分型%聚類分析%管傢基因
기폐군단균%서렬분형%취류분석%관가기인
目的 为了解温州市中央空调冷却塔水中嗜肺军团菌(Legionella pneumophila,LP)基因特征,采用序列分型方法(sequenced-based typing,SBT)对公共场所中央空调冷却塔水中的嗜肺军团菌进行分子分型研究.方法选择嗜肺军团菌的7 个管家基因 flaA、asd、mip、pilE、mompS、proA 和 neuA 作为目的 基因,对温州市公共场所中央空调冷却塔水中分离的31株嗜肺军团菌进行PCR扩增并测序.测序结果上传欧盟军团菌感染工作组(EWGLI)数据库进行比对、分型.运用DNAsp 5.0 、Bionumerics5.1及SplitsTree 等软件对分型结果进行分析.结果 31株嗜肺军团菌中,11株LP1型被分为2种ST型;17株非LP1型被分为8种ST型,其中7种ST型是新发现的序列型,并新发现1个等位基因;另3株非LP1型因缺少neuA基因未被数据库确认.7个管家基因的核苷酸多态性 (Pi)范围为0.00995(mip)~0.02311(flaA).flaA具有最大的核苷酸多态性 ( 0.02311 ).经聚类分析得到本地分离的嗜肺军团菌株的遗传进化关系.结论 温州市公共场所冷却塔水中的嗜肺军团菌与国内外其他地区报道的嗜肺军团菌具有一定的亲缘关系,同时也具有地区特异性和遗传多样性.
目的 為瞭解溫州市中央空調冷卻塔水中嗜肺軍糰菌(Legionella pneumophila,LP)基因特徵,採用序列分型方法(sequenced-based typing,SBT)對公共場所中央空調冷卻塔水中的嗜肺軍糰菌進行分子分型研究.方法選擇嗜肺軍糰菌的7 箇管傢基因 flaA、asd、mip、pilE、mompS、proA 和 neuA 作為目的 基因,對溫州市公共場所中央空調冷卻塔水中分離的31株嗜肺軍糰菌進行PCR擴增併測序.測序結果上傳歐盟軍糰菌感染工作組(EWGLI)數據庫進行比對、分型.運用DNAsp 5.0 、Bionumerics5.1及SplitsTree 等軟件對分型結果進行分析.結果 31株嗜肺軍糰菌中,11株LP1型被分為2種ST型;17株非LP1型被分為8種ST型,其中7種ST型是新髮現的序列型,併新髮現1箇等位基因;另3株非LP1型因缺少neuA基因未被數據庫確認.7箇管傢基因的覈苷痠多態性 (Pi)範圍為0.00995(mip)~0.02311(flaA).flaA具有最大的覈苷痠多態性 ( 0.02311 ).經聚類分析得到本地分離的嗜肺軍糰菌株的遺傳進化關繫.結論 溫州市公共場所冷卻塔水中的嗜肺軍糰菌與國內外其他地區報道的嗜肺軍糰菌具有一定的親緣關繫,同時也具有地區特異性和遺傳多樣性.
목적 위료해온주시중앙공조냉각탑수중기폐군단균(Legionella pneumophila,LP)기인특정,채용서렬분형방법(sequenced-based typing,SBT)대공공장소중앙공조냉각탑수중적기폐군단균진행분자분형연구.방법선택기폐군단균적7 개관가기인 flaA、asd、mip、pilE、mompS、proA 화 neuA 작위목적 기인,대온주시공공장소중앙공조냉각탑수중분리적31주기폐군단균진행PCR확증병측서.측서결과상전구맹군단균감염공작조(EWGLI)수거고진행비대、분형.운용DNAsp 5.0 、Bionumerics5.1급SplitsTree 등연건대분형결과진행분석.결과 31주기폐군단균중,11주LP1형피분위2충ST형;17주비LP1형피분위8충ST형,기중7충ST형시신발현적서렬형,병신발현1개등위기인;령3주비LP1형인결소neuA기인미피수거고학인.7개관가기인적핵감산다태성 (Pi)범위위0.00995(mip)~0.02311(flaA).flaA구유최대적핵감산다태성 ( 0.02311 ).경취류분석득도본지분리적기폐군단균주적유전진화관계.결론 온주시공공장소냉각탑수중적기폐군단균여국내외기타지구보도적기폐군단균구유일정적친연관계,동시야구유지구특이성화유전다양성.