热带作物学报
熱帶作物學報
열대작물학보
CHINESE JOURNAL OF TROPICAL CROPS
2013年
2期
292-296
,共5页
姜翠翠%陈桂信%潘东明%赖燕%郑鸿昌
薑翠翠%陳桂信%潘東明%賴燕%鄭鴻昌
강취취%진계신%반동명%뢰연%정홍창
(木奈)%褐变%均一化全长cDNA文库%表达序列标签
(木奈)%褐變%均一化全長cDNA文庫%錶達序列標籤
(목내)%갈변%균일화전장cDNA문고%표체서렬표첨
以发生褐变初期的(木奈)果肉总RNA为材料,对SMARTTM cDNA合成方法进行改良,并将长距离PCR、DSN处理和定向克隆相结合,成功构建(木奈)褐变果实均一化全长cDNA文库.经检测,该文库的初始滴度为2.0×106 pfu/mL,重组率为99％,插入片段大小平均为1.8 kb,文库质量良好.随机挑取720个阳性克隆进行5'EST测序,共获得684条有效的ESTs序列；并将684条有效序列拼接后,58条被组装成21个重叠群(contigs),单拷贝(singlets)基因有626条,共得到647个单基因簇(unigenes),文库冗余率为8.4％.用Blast 2 go在线软件对测序结果进行功能注释和归类分析,结果显示,已知功能基因与能量代谢、蛋白质合成与降解、次生代谢物质、细胞壁代谢和转录因子有关.该文库的构建有利于从分子水平上研究(木奈)果实褐变发生的机制.
以髮生褐變初期的(木奈)果肉總RNA為材料,對SMARTTM cDNA閤成方法進行改良,併將長距離PCR、DSN處理和定嚮剋隆相結閤,成功構建(木奈)褐變果實均一化全長cDNA文庫.經檢測,該文庫的初始滴度為2.0×106 pfu/mL,重組率為99％,插入片段大小平均為1.8 kb,文庫質量良好.隨機挑取720箇暘性剋隆進行5'EST測序,共穫得684條有效的ESTs序列；併將684條有效序列拼接後,58條被組裝成21箇重疊群(contigs),單拷貝(singlets)基因有626條,共得到647箇單基因簇(unigenes),文庫冗餘率為8.4％.用Blast 2 go在線軟件對測序結果進行功能註釋和歸類分析,結果顯示,已知功能基因與能量代謝、蛋白質閤成與降解、次生代謝物質、細胞壁代謝和轉錄因子有關.該文庫的構建有利于從分子水平上研究(木奈)果實褐變髮生的機製.
이발생갈변초기적(목내)과육총RNA위재료,대SMARTTM cDNA합성방법진행개량,병장장거리PCR、DSN처리화정향극륭상결합,성공구건(목내)갈변과실균일화전장cDNA문고.경검측,해문고적초시적도위2.0×106 pfu/mL,중조솔위99％,삽입편단대소평균위1.8 kb,문고질량량호.수궤도취720개양성극륭진행5'EST측서,공획득684조유효적ESTs서렬；병장684조유효서렬병접후,58조피조장성21개중첩군(contigs),단고패(singlets)기인유626조,공득도647개단기인족(unigenes),문고용여솔위8.4％.용Blast 2 go재선연건대측서결과진행공능주석화귀류분석,결과현시,이지공능기인여능량대사、단백질합성여강해、차생대사물질、세포벽대사화전록인자유관.해문고적구건유리우종분자수평상연구(목내)과실갈변발생적궤제.
