生物信息学
生物信息學
생물신식학
BIOINFORMATICS
2013年
3期
237-242
,共6页
赵哲%谭钟扬%李世访%王红清
趙哲%譚鐘颺%李世訪%王紅清
조철%담종양%리세방%왕홍청
柑橘衰退病毒%简单重复序列%植物病毒
柑橘衰退病毒%簡單重複序列%植物病毒
감귤쇠퇴병독%간단중복서렬%식물병독
Citrus Tristeza Virus%Simple Sequence Repeats%Plant Viruses
柑橘衰退病毒(Citrus tristeza virus,CTV)属于长线性病毒科(Closteroviridae),是目前已知植物病毒中基因组最大的病毒,其引起的柑橘衰退病对全世界的柑橘产业造成着严重影响.本文以在GenBank登录的32条全长CTV基因组序列为材料,分析简单重复序列(Simple Sequence Repeats,SSRs)在其基因组序列中的分布情况.研究结果显示,在所有的CTV基因组中均有SSRs的分布,SSRs重复次数较少,二型SSRs占主导地位,未在CTV基因组序列中发现五型和六型SSRs.在32条基因组全长序列中仅在5条序列中发现四型SSRs.这是首次以柑橘病毒为材料进行的SSRs分析研究.
柑橘衰退病毒(Citrus tristeza virus,CTV)屬于長線性病毒科(Closteroviridae),是目前已知植物病毒中基因組最大的病毒,其引起的柑橘衰退病對全世界的柑橘產業造成著嚴重影響.本文以在GenBank登錄的32條全長CTV基因組序列為材料,分析簡單重複序列(Simple Sequence Repeats,SSRs)在其基因組序列中的分佈情況.研究結果顯示,在所有的CTV基因組中均有SSRs的分佈,SSRs重複次數較少,二型SSRs佔主導地位,未在CTV基因組序列中髮現五型和六型SSRs.在32條基因組全長序列中僅在5條序列中髮現四型SSRs.這是首次以柑橘病毒為材料進行的SSRs分析研究.
감귤쇠퇴병독(Citrus tristeza virus,CTV)속우장선성병독과(Closteroviridae),시목전이지식물병독중기인조최대적병독,기인기적감귤쇠퇴병대전세계적감귤산업조성착엄중영향.본문이재GenBank등록적32조전장CTV기인조서렬위재료,분석간단중복서렬(Simple Sequence Repeats,SSRs)재기기인조서렬중적분포정황.연구결과현시,재소유적CTV기인조중균유SSRs적분포,SSRs중복차수교소,이형SSRs점주도지위,미재CTV기인조서렬중발현오형화륙형SSRs.재32조기인조전장서렬중부재5조서렬중발현사형SSRs.저시수차이감귤병독위재료진행적SSRs분석연구.
