生物信息学
生物信息學
생물신식학
BIOINFORMATICS
2013年
3期
224-232
,共9页
油菜%蔗糖转化酶基因%电子克隆%生物信息学
油菜%蔗糖轉化酶基因%電子剋隆%生物信息學
유채%자당전화매기인%전자극륭%생물신식학
Brassica Napus%Invertase Gene%In Silico Cloning%Bioinformatics
运用电子克隆技术获得油菜中一个蔗糖转化酶基因cDNA序列,同时根据此段序列设计引物以油菜cDNA为模板进行扩增,经测序得到证实.采用生物信息学方法,对该基因编码蛋白从氨基酸组成、基本理化性质、跨膜结构域、信号肽导肽、疏水性/亲水性、二级结构、亚细胞定位等方面进行了预测和分析.结果表明:该基因cDNA序列长度为2150bp,包含一个1779bp开放阅读框,编码592个氨基酸；该编码蛋白含有蔗糖转化酶的多个典型的保守结构域.同源比对分析显示,该基因编码的氨基酸序列与拟南芥等植物的蔗糖转化酶基因具有高度的相似性,进一步确定该蛋白为蔗糖蛋白酶.研究结果为该基因进一步的实验克隆,表达分析,功能鉴定奠定基础.
運用電子剋隆技術穫得油菜中一箇蔗糖轉化酶基因cDNA序列,同時根據此段序列設計引物以油菜cDNA為模闆進行擴增,經測序得到證實.採用生物信息學方法,對該基因編碼蛋白從氨基痠組成、基本理化性質、跨膜結構域、信號肽導肽、疏水性/親水性、二級結構、亞細胞定位等方麵進行瞭預測和分析.結果錶明:該基因cDNA序列長度為2150bp,包含一箇1779bp開放閱讀框,編碼592箇氨基痠；該編碼蛋白含有蔗糖轉化酶的多箇典型的保守結構域.同源比對分析顯示,該基因編碼的氨基痠序列與擬南芥等植物的蔗糖轉化酶基因具有高度的相似性,進一步確定該蛋白為蔗糖蛋白酶.研究結果為該基因進一步的實驗剋隆,錶達分析,功能鑒定奠定基礎.
운용전자극륭기술획득유채중일개자당전화매기인cDNA서렬,동시근거차단서렬설계인물이유채cDNA위모판진행확증,경측서득도증실.채용생물신식학방법,대해기인편마단백종안기산조성、기본이화성질、과막결구역、신호태도태、소수성/친수성、이급결구、아세포정위등방면진행료예측화분석.결과표명:해기인cDNA서렬장도위2150bp,포함일개1779bp개방열독광,편마592개안기산；해편마단백함유자당전화매적다개전형적보수결구역.동원비대분석현시,해기인편마적안기산서렬여의남개등식물적자당전화매기인구유고도적상사성,진일보학정해단백위자당단백매.연구결과위해기인진일보적실험극륭,표체분석,공능감정전정기출.
