江西农业大学学报
江西農業大學學報
강서농업대학학보
ACTA AGRICULTURAE UNIVERSITATIS JIANGXIENSIS
2013年
5期
962-969
,共8页
刘美兰%谭晓风%龙洪旭%张琳%周俊琴%王建勇
劉美蘭%譚曉風%龍洪旭%張琳%週俊琴%王建勇
류미란%담효풍%룡홍욱%장림%주준금%왕건용
油桐%β-酮脂酰-ACP还原酶%Vf_KAR1%Vf_KAR2%生物信息学
油桐%β-酮脂酰-ACP還原酶%Vf_KAR1%Vf_KAR2%生物信息學
유동%β-동지선-ACP환원매%Vf_KAR1%Vf_KAR2%생물신식학
Vernicia fordii%β-ketoacyl-ACP reductase%Vf_KAR1%Vf_KAR2%Bioinformatics
以葡萄桐近成熟种子为材料,根据油桐转录组测序分析结果设计引物,利用RT-PCR技术克隆获得了2条KAR基因的全长cDNA,分别命名为Vf_KAR1和Vf _KAR2(GenBank登录号:KF025646,KF025647).生物信息学分析结果表明,Vf_KAR1和Vf_KAR2基因的CDS长度分别为993 bp和900 bp,分别编码331个和300个氨基酸;与其它物种的KAR氨基酸序列具有较高的相似性,Vf_KAR1与蓖麻的相似度最高,达82％;Vf_KAR2基因与花生、辣椒的相似度高达76％;2条KAR基因的多肽都含叶绿体转运肽,但是都没有信号肽;Vf_KAR1有1个明显的跨膜螺旋拓扑结构和1个疑似跨膜螺旋拓扑结构,Vf_KAR2有2个疑似的跨膜螺旋拓扑结构;肽链都表现为疏水性,都有典型的活化中心三联体(Ser-Tyr-Lys);三级结构都有典型的Rossmarn折叠特征.因此,初步推测Vf_KAR1和Vf_KAR2是油桐β-酮脂酰-ACP还原酶KAR基因家族的两个成员.
以葡萄桐近成熟種子為材料,根據油桐轉錄組測序分析結果設計引物,利用RT-PCR技術剋隆穫得瞭2條KAR基因的全長cDNA,分彆命名為Vf_KAR1和Vf _KAR2(GenBank登錄號:KF025646,KF025647).生物信息學分析結果錶明,Vf_KAR1和Vf_KAR2基因的CDS長度分彆為993 bp和900 bp,分彆編碼331箇和300箇氨基痠;與其它物種的KAR氨基痠序列具有較高的相似性,Vf_KAR1與蓖痳的相似度最高,達82％;Vf_KAR2基因與花生、辣椒的相似度高達76％;2條KAR基因的多肽都含葉綠體轉運肽,但是都沒有信號肽;Vf_KAR1有1箇明顯的跨膜螺鏇拓撲結構和1箇疑似跨膜螺鏇拓撲結構,Vf_KAR2有2箇疑似的跨膜螺鏇拓撲結構;肽鏈都錶現為疏水性,都有典型的活化中心三聯體(Ser-Tyr-Lys);三級結構都有典型的Rossmarn摺疊特徵.因此,初步推測Vf_KAR1和Vf_KAR2是油桐β-酮脂酰-ACP還原酶KAR基因傢族的兩箇成員.
이포도동근성숙충자위재료,근거유동전록조측서분석결과설계인물,이용RT-PCR기술극륭획득료2조KAR기인적전장cDNA,분별명명위Vf_KAR1화Vf _KAR2(GenBank등록호:KF025646,KF025647).생물신식학분석결과표명,Vf_KAR1화Vf_KAR2기인적CDS장도분별위993 bp화900 bp,분별편마331개화300개안기산;여기타물충적KAR안기산서렬구유교고적상사성,Vf_KAR1여비마적상사도최고,체82％;Vf_KAR2기인여화생、랄초적상사도고체76％;2조KAR기인적다태도함협록체전운태,단시도몰유신호태;Vf_KAR1유1개명현적과막라선탁복결구화1개의사과막라선탁복결구,Vf_KAR2유2개의사적과막라선탁복결구;태련도표현위소수성,도유전형적활화중심삼련체(Ser-Tyr-Lys);삼급결구도유전형적Rossmarn절첩특정.인차,초보추측Vf_KAR1화Vf_KAR2시유동β-동지선-ACP환원매KAR기인가족적량개성원.
