陕西林业科技
陝西林業科技
협서임업과기
SHAANXI FOREST SCIENCE AND TECHNOLOGY
2013年
2期
100-108
,共9页
本文报道黑三角叶杨(Populus trichocarpa Torr.& Gray),也即毛果杨全基因组序列测定及分析结果.采用鸟枪测序法并结合遗传作图最终获得该物种全基因组序列草图.本研究还鉴定出45 000多个蛋白质编码基因.分析结果进一步显示,该物种在杨柳科属种分化之前曾经历过一次全基因组复制事件,大约有8 000对经复制产生的重复基因至今依然保留在杨属基因组之中;至于年代更为久远的另一次复制事件则发生在杨属与拟南芥属种系分化之前.与拟南芥属相比,杨属植物在核苷酸取代,串联基因重复,以及染色体重排上似乎均显得较为缓慢.杨属基因组的蛋白质编码基因明显多于拟南芥属,每一个拟南芥基因平均约存在1.4至1.6个杨属同系物.不过,该两个基因组中蛋白质结构域的相对频率基本相同.此外,在杨属基因组中还发现大量与木质素纤维素壁生物合成,分生组织发育,抗性,以及代谢物转运相关的特异性基因.
本文報道黑三角葉楊(Populus trichocarpa Torr.& Gray),也即毛果楊全基因組序列測定及分析結果.採用鳥鎗測序法併結閤遺傳作圖最終穫得該物種全基因組序列草圖.本研究還鑒定齣45 000多箇蛋白質編碼基因.分析結果進一步顯示,該物種在楊柳科屬種分化之前曾經歷過一次全基因組複製事件,大約有8 000對經複製產生的重複基因至今依然保留在楊屬基因組之中;至于年代更為久遠的另一次複製事件則髮生在楊屬與擬南芥屬種繫分化之前.與擬南芥屬相比,楊屬植物在覈苷痠取代,串聯基因重複,以及染色體重排上似乎均顯得較為緩慢.楊屬基因組的蛋白質編碼基因明顯多于擬南芥屬,每一箇擬南芥基因平均約存在1.4至1.6箇楊屬同繫物.不過,該兩箇基因組中蛋白質結構域的相對頻率基本相同.此外,在楊屬基因組中還髮現大量與木質素纖維素壁生物閤成,分生組織髮育,抗性,以及代謝物轉運相關的特異性基因.
본문보도흑삼각협양(Populus trichocarpa Torr.& Gray),야즉모과양전기인조서렬측정급분석결과.채용조창측서법병결합유전작도최종획득해물충전기인조서렬초도.본연구환감정출45 000다개단백질편마기인.분석결과진일보현시,해물충재양류과속충분화지전증경력과일차전기인조복제사건,대약유8 000대경복제산생적중복기인지금의연보류재양속기인조지중;지우년대경위구원적령일차복제사건칙발생재양속여의남개속충계분화지전.여의남개속상비,양속식물재핵감산취대,천련기인중복,이급염색체중배상사호균현득교위완만.양속기인조적단백질편마기인명현다우의남개속,매일개의남개기인평균약존재1.4지1.6개양속동계물.불과,해량개기인조중단백질결구역적상대빈솔기본상동.차외,재양속기인조중환발현대량여목질소섬유소벽생물합성,분생조직발육,항성,이급대사물전운상관적특이성기인.