热带农业科学
熱帶農業科學
열대농업과학
CHINESE JOURNAL OF TROPICAL AGRICULTURE
2013年
4期
30-35
,共6页
邹智%杨礼富%安峰%王真辉%袁坤%庄美露
鄒智%楊禮富%安峰%王真輝%袁坤%莊美露
추지%양례부%안봉%왕진휘%원곤%장미로
巴西橡胶树%拟南芥%CAB1基因%稳定期叶片%衰老期叶片
巴西橡膠樹%擬南芥%CAB1基因%穩定期葉片%衰老期葉片
파서상효수%의남개%CAB1기인%은정기협편%쇠로기협편
以一编码蛋白与拟南芥的CAB1高度相似的EST序列作为探针,通过同源搜索从橡胶树的转录组数据中电子克隆到一条长1415 bp的cDNA,该序列包含-798 bp的ORF及47 bp的5’UTR和570 bp的3’UTR,命名为HbCAB1;在此基础上,采用PCR技术成功扩增了包括该ORF在内的915 bp的cDNA序列.序列分析表明,该基因预测编码265个氨基酸,理论分子量为28.15 ku,等电点为5.25;蛋白含有1个保守的捕光叶绿素a/b结合蛋白结构域,3个跨膜螺旋和1个C端螺旋,1个三聚化基序,以及多个叶绿素和类胡萝卜素结合位点;蛋白与蓖麻(Ricinus communis)、杨树(Populus trichocarpa)、橄榄(Canarium album)中同源蛋白的相似性都在95％以上,显示出基因进化的保守性.半定量RT-PCR分析显示,与稳定期叶片相比,HbCAB1在衰老期叶片中的转录水平显著下调.
以一編碼蛋白與擬南芥的CAB1高度相似的EST序列作為探針,通過同源搜索從橡膠樹的轉錄組數據中電子剋隆到一條長1415 bp的cDNA,該序列包含-798 bp的ORF及47 bp的5’UTR和570 bp的3’UTR,命名為HbCAB1;在此基礎上,採用PCR技術成功擴增瞭包括該ORF在內的915 bp的cDNA序列.序列分析錶明,該基因預測編碼265箇氨基痠,理論分子量為28.15 ku,等電點為5.25;蛋白含有1箇保守的捕光葉綠素a/b結閤蛋白結構域,3箇跨膜螺鏇和1箇C耑螺鏇,1箇三聚化基序,以及多箇葉綠素和類鬍蘿蔔素結閤位點;蛋白與蓖痳(Ricinus communis)、楊樹(Populus trichocarpa)、橄欖(Canarium album)中同源蛋白的相似性都在95％以上,顯示齣基因進化的保守性.半定量RT-PCR分析顯示,與穩定期葉片相比,HbCAB1在衰老期葉片中的轉錄水平顯著下調.
이일편마단백여의남개적CAB1고도상사적EST서렬작위탐침,통과동원수색종상효수적전록조수거중전자극륭도일조장1415 bp적cDNA,해서렬포함-798 bp적ORF급47 bp적5’UTR화570 bp적3’UTR,명명위HbCAB1;재차기출상,채용PCR기술성공확증료포괄해ORF재내적915 bp적cDNA서렬.서렬분석표명,해기인예측편마265개안기산,이론분자량위28.15 ku,등전점위5.25;단백함유1개보수적포광협록소a/b결합단백결구역,3개과막라선화1개C단라선,1개삼취화기서,이급다개협록소화류호라복소결합위점;단백여비마(Ricinus communis)、양수(Populus trichocarpa)、감람(Canarium album)중동원단백적상사성도재95％이상,현시출기인진화적보수성.반정량RT-PCR분석현시,여은정기협편상비,HbCAB1재쇠로기협편중적전록수평현저하조.
