中国畜牧杂志
中國畜牧雜誌
중국축목잡지
CHINESE JOURNAL OF ANIMAL SCIENCE
2013年
5期
5-9
,共5页
何桦%王浩瀚%刘贺贺%潘志雄%王继文
何樺%王浩瀚%劉賀賀%潘誌雄%王繼文
하화%왕호한%류하하%반지웅%왕계문
ATP5E%克隆%生物信息学分析%鹅
ATP5E%剋隆%生物信息學分析%鵝
ATP5E%극륭%생물신식학분석%아
线粒体ATP酶合成体ε亚基(ATP synthase,H+transporting,mitochondrial F1 complex,epsilon,ATP5E)是ATP合成酶催化中心的最小亚基,在能量代谢过程中具有重要作用.本研究利用RT-PCR和RACE技术获得鹅ATP5E序列,并结合生物信息学方法对鹅ATP5E的序列进行深入分析.结果表明:克隆获得鹅ATP5E基因序列全长为347 bp,包括156 bp的编码区序列,编码51个氨基酸.同源性分析发现,鹅ATP5E核苷酸序列与推测氨基酸序列与原鸡的同源性最高,分别达到87.74％和89.58％,而与其他物种之间的一致性差异稍大.氨基酸序列分析发现该基因编码蛋白理论分子量为水溶性蛋白,相对分子量为5.79 ku,理论等电点为10.01,无信号肽序列和跨膜区,预测含有4个磷酸化位点,二级结构以α螺旋为主,预测ATP5E蛋白主要在能量代谢和脂肪酸代谢过程中有着关键作用.以上研究为进一步探讨ATPSE基因在鹅肝脂肪变性过程中的功能研究奠定了信息基础.
線粒體ATP酶閤成體ε亞基(ATP synthase,H+transporting,mitochondrial F1 complex,epsilon,ATP5E)是ATP閤成酶催化中心的最小亞基,在能量代謝過程中具有重要作用.本研究利用RT-PCR和RACE技術穫得鵝ATP5E序列,併結閤生物信息學方法對鵝ATP5E的序列進行深入分析.結果錶明:剋隆穫得鵝ATP5E基因序列全長為347 bp,包括156 bp的編碼區序列,編碼51箇氨基痠.同源性分析髮現,鵝ATP5E覈苷痠序列與推測氨基痠序列與原鷄的同源性最高,分彆達到87.74％和89.58％,而與其他物種之間的一緻性差異稍大.氨基痠序列分析髮現該基因編碼蛋白理論分子量為水溶性蛋白,相對分子量為5.79 ku,理論等電點為10.01,無信號肽序列和跨膜區,預測含有4箇燐痠化位點,二級結構以α螺鏇為主,預測ATP5E蛋白主要在能量代謝和脂肪痠代謝過程中有著關鍵作用.以上研究為進一步探討ATPSE基因在鵝肝脂肪變性過程中的功能研究奠定瞭信息基礎.
선립체ATP매합성체ε아기(ATP synthase,H+transporting,mitochondrial F1 complex,epsilon,ATP5E)시ATP합성매최화중심적최소아기,재능량대사과정중구유중요작용.본연구이용RT-PCR화RACE기술획득아ATP5E서렬,병결합생물신식학방법대아ATP5E적서렬진행심입분석.결과표명:극륭획득아ATP5E기인서렬전장위347 bp,포괄156 bp적편마구서렬,편마51개안기산.동원성분석발현,아ATP5E핵감산서렬여추측안기산서렬여원계적동원성최고,분별체도87.74％화89.58％,이여기타물충지간적일치성차이초대.안기산서렬분석발현해기인편마단백이론분자량위수용성단백,상대분자량위5.79 ku,이론등전점위10.01,무신호태서렬화과막구,예측함유4개린산화위점,이급결구이α라선위주,예측ATP5E단백주요재능량대사화지방산대사과정중유착관건작용.이상연구위진일보탐토ATPSE기인재아간지방변성과정중적공능연구전정료신식기출.
