农业生物技术学报
農業生物技術學報
농업생물기술학보
JOURNAL OF AGRICULTURAL BIOTECHNOLOGY
2013年
5期
537-545
,共9页
肖卫民%赵名琛%邹敏%苏承刚%杜小兵%谭远德%张兴国
肖衛民%趙名琛%鄒敏%囌承剛%杜小兵%譚遠德%張興國
초위민%조명침%추민%소승강%두소병%담원덕%장흥국
拟南芥%受伤花梗%根癌农杆菌GV3101%转录组
擬南芥%受傷花梗%根癌農桿菌GV3101%轉錄組
의남개%수상화경%근암농간균GV3101%전록조
根癌农杆菌(Agrobacterium tumefaciens)侵染植物会引起感染细胞的基因转录发生变化.明确其间的基因转录模式,有助于揭示农杆菌的致病机理和改善农杆菌介导的遗传转化技术.本研究采用RAM(ranking analysis of microarray data)统计方法,分析拟南芥(Arabidopsis thaliana)受伤和接种农杆菌GV3101后第3小时至第6天的转录组变化,采用MapMan软件分析所得差异转录基因的功能类别与分布.结果显示,农杆菌GV3101导致4 651个基因差异转录,而受伤时有3 885个基因的转录发生改变,两者之间有1 045个相同基因.接种农杆菌GV3101后拟南芥基础代谢相关的差异转录基因数目减少,并且使胁迫途径中植物致病相关蛋白(pathogenesis-related proteins,PRproteins)的编码基因转录变化显著,其中37个NB-LRR (nucleotide-binding site,leucine-rich repeat)型抗病蛋白(resistance proteins,R proteins)的编码基因转录水平明显下降.受伤时只有6个NB-LRR型蛋白的编码基因转录下调.研究结果表明,接种根癌农杆菌GV3101后拟南芥细胞的转录模式明显改变,抗病能力受到抑制,有利于农杆菌T-DNA的整合和致病.
根癌農桿菌(Agrobacterium tumefaciens)侵染植物會引起感染細胞的基因轉錄髮生變化.明確其間的基因轉錄模式,有助于揭示農桿菌的緻病機理和改善農桿菌介導的遺傳轉化技術.本研究採用RAM(ranking analysis of microarray data)統計方法,分析擬南芥(Arabidopsis thaliana)受傷和接種農桿菌GV3101後第3小時至第6天的轉錄組變化,採用MapMan軟件分析所得差異轉錄基因的功能類彆與分佈.結果顯示,農桿菌GV3101導緻4 651箇基因差異轉錄,而受傷時有3 885箇基因的轉錄髮生改變,兩者之間有1 045箇相同基因.接種農桿菌GV3101後擬南芥基礎代謝相關的差異轉錄基因數目減少,併且使脅迫途徑中植物緻病相關蛋白(pathogenesis-related proteins,PRproteins)的編碼基因轉錄變化顯著,其中37箇NB-LRR (nucleotide-binding site,leucine-rich repeat)型抗病蛋白(resistance proteins,R proteins)的編碼基因轉錄水平明顯下降.受傷時隻有6箇NB-LRR型蛋白的編碼基因轉錄下調.研究結果錶明,接種根癌農桿菌GV3101後擬南芥細胞的轉錄模式明顯改變,抗病能力受到抑製,有利于農桿菌T-DNA的整閤和緻病.
근암농간균(Agrobacterium tumefaciens)침염식물회인기감염세포적기인전록발생변화.명학기간적기인전록모식,유조우게시농간균적치병궤리화개선농간균개도적유전전화기술.본연구채용RAM(ranking analysis of microarray data)통계방법,분석의남개(Arabidopsis thaliana)수상화접충농간균GV3101후제3소시지제6천적전록조변화,채용MapMan연건분석소득차이전록기인적공능유별여분포.결과현시,농간균GV3101도치4 651개기인차이전록,이수상시유3 885개기인적전록발생개변,량자지간유1 045개상동기인.접충농간균GV3101후의남개기출대사상관적차이전록기인수목감소,병차사협박도경중식물치병상관단백(pathogenesis-related proteins,PRproteins)적편마기인전록변화현저,기중37개NB-LRR (nucleotide-binding site,leucine-rich repeat)형항병단백(resistance proteins,R proteins)적편마기인전록수평명현하강.수상시지유6개NB-LRR형단백적편마기인전록하조.연구결과표명,접충근암농간균GV3101후의남개세포적전록모식명현개변,항병능력수도억제,유리우농간균T-DNA적정합화치병.