CAJ | 학술논문

下载GenBank数据库中已公布的菊花EST序列7 087条,利用GS De nove Assembler软件进行叠连群构建,EST序列构建275个叠连群,长度共计142 713 bp,发现候选SNP位点214个,SNP平均出现频率为0.15％,共有52个contigs含有SNP位点,每个contig含有4.12个SNP位点,一个contig含有的SNP位点数最多的是40个,40.39％的contigs只含有1个SNP位点；不同叠连群所含SNP位点的数量差异较大,且转换类型明显高于颠换类型；Contigs的总长度是142 713 bp,平均666.9 bp含有1个SNP位点.另外,还应用Primer Premier 5.0,按照引物设计要求,共设计出1 322对EST-SNP引物.
하재GenBank수거고중이공포적국화EST서렬7 087조,이용GS De nove Assembler연건진행첩련군구건,EST서렬구건275개첩련군,장도공계142 713 bp,발현후선SNP위점214개,SNP평균출현빈솔위0.15％,공유52개contigs함유SNP위점,매개contig함유4.12개SNP위점,일개contig함유적SNP위점수최다적시40개,40.39％적contigs지함유1개SNP위점；불동첩련군소함SNP위점적수량차이교대,차전환류형명현고우전환류형；Contigs적총장도시142 713 bp,평균666.9 bp함유1개SNP위점.령외,환응용Primer Premier 5.0,안조인물설계요구,공설계출1 322대EST-SNP인물.