安徽医科大学学报
安徽醫科大學學報
안휘의과대학학보
ACTA UNIVERSITY MEDICINALIS ANHUI
2013年
7期
725-729
,共5页
乳腺癌%非负矩阵分解%基因表达谱数据
乳腺癌%非負矩陣分解%基因錶達譜數據
유선암%비부구진분해%기인표체보수거
目的 利用改进稀疏非负矩阵分解技术对乳腺癌基因表达谱数据进行双向聚类,挖掘与乳腺癌发病密切相关的基因及其生物过程.方法 用小波对22 283个基因的人乳腺癌基因表达数据进行去噪,然后通过T统计初步筛选出5 067个基因作为改进稀疏非负矩阵的输入矩阵,进行双向聚类进一步筛选出81个与乳腺癌密切相关的显著基因,最后通过cytoscape对81个与乳腺癌密切相关的显著基因构建生物过程结构图.结果 筛选出与乳腺癌相关的基因、可能相关的基因以及这些基因参与的生物过程之间的关系.结论 改进稀疏非负矩阵分解与现存的其他非负矩阵分解算法相比具有聚类效果好、稳定性强且迭代次数少的优点,适合于乳腺癌差异表达基因的提取.
目的 利用改進稀疏非負矩陣分解技術對乳腺癌基因錶達譜數據進行雙嚮聚類,挖掘與乳腺癌髮病密切相關的基因及其生物過程.方法 用小波對22 283箇基因的人乳腺癌基因錶達數據進行去譟,然後通過T統計初步篩選齣5 067箇基因作為改進稀疏非負矩陣的輸入矩陣,進行雙嚮聚類進一步篩選齣81箇與乳腺癌密切相關的顯著基因,最後通過cytoscape對81箇與乳腺癌密切相關的顯著基因構建生物過程結構圖.結果 篩選齣與乳腺癌相關的基因、可能相關的基因以及這些基因參與的生物過程之間的關繫.結論 改進稀疏非負矩陣分解與現存的其他非負矩陣分解算法相比具有聚類效果好、穩定性彊且迭代次數少的優點,適閤于乳腺癌差異錶達基因的提取.
목적 이용개진희소비부구진분해기술대유선암기인표체보수거진행쌍향취류,알굴여유선암발병밀절상관적기인급기생물과정.방법 용소파대22 283개기인적인유선암기인표체수거진행거조,연후통과T통계초보사선출5 067개기인작위개진희소비부구진적수입구진,진행쌍향취류진일보사선출81개여유선암밀절상관적현저기인,최후통과cytoscape대81개여유선암밀절상관적현저기인구건생물과정결구도.결과 사선출여유선암상관적기인、가능상관적기인이급저사기인삼여적생물과정지간적관계.결론 개진희소비부구진분해여현존적기타비부구진분해산법상비구유취류효과호、은정성강차질대차수소적우점,괄합우유선암차이표체기인적제취.
