云南农业大学学报
雲南農業大學學報
운남농업대학학보
JOURNAL OF YUNNAN AGRICULTURAL UNIVERSITY
2013年
3期
310-316
,共7页
吴德喜%袁恩平%王连春%蔡红%陈海如
吳德喜%袁恩平%王連春%蔡紅%陳海如
오덕희%원은평%왕련춘%채홍%진해여
苦楝丛枝植原体%膜蛋白%secY%amp%结构预测
苦楝叢枝植原體%膜蛋白%secY%amp%結構預測
고련총지식원체%막단백%secY%amp%결구예측
根据植原体编码蛋白转运系统SecY亚基以及抗原膜蛋白amp基因的保守序列分别设计引物,并采用PCR对采自云南文山的苦楝丛枝感病植株总DNA进行扩增、产物克隆及序列测定.结果显示扩增的SecY亚基DNA片段长1 354 bp,编码一个包含414个氨基酸的SecY蛋白,序列同源性显示该片段与“Ca.Phytoplasma asteris”(16SrI组)中的株系最高,达94% ~ 99%;构建16SrⅠ组内基于secY序列的系统进化树,认为该株系为secY(Ⅰ)-O亚组.扩增的免疫膜蛋白DNA片段长1 176 bp,编码1个包含233个氨基酸的免疫膜蛋白(Amp).蛋白结构预测显示secY亚基蛋白是一个有9个跨膜区的整合跨膜蛋白,而Amp蛋白是一类两端具有明显跨膜区,且N-端有多肽切割位点的Ⅲ型膜蛋白.
根據植原體編碼蛋白轉運繫統SecY亞基以及抗原膜蛋白amp基因的保守序列分彆設計引物,併採用PCR對採自雲南文山的苦楝叢枝感病植株總DNA進行擴增、產物剋隆及序列測定.結果顯示擴增的SecY亞基DNA片段長1 354 bp,編碼一箇包含414箇氨基痠的SecY蛋白,序列同源性顯示該片段與“Ca.Phytoplasma asteris”(16SrI組)中的株繫最高,達94% ~ 99%;構建16SrⅠ組內基于secY序列的繫統進化樹,認為該株繫為secY(Ⅰ)-O亞組.擴增的免疫膜蛋白DNA片段長1 176 bp,編碼1箇包含233箇氨基痠的免疫膜蛋白(Amp).蛋白結構預測顯示secY亞基蛋白是一箇有9箇跨膜區的整閤跨膜蛋白,而Amp蛋白是一類兩耑具有明顯跨膜區,且N-耑有多肽切割位點的Ⅲ型膜蛋白.
근거식원체편마단백전운계통SecY아기이급항원막단백amp기인적보수서렬분별설계인물,병채용PCR대채자운남문산적고련총지감병식주총DNA진행확증、산물극륭급서렬측정.결과현시확증적SecY아기DNA편단장1 354 bp,편마일개포함414개안기산적SecY단백,서렬동원성현시해편단여“Ca.Phytoplasma asteris”(16SrI조)중적주계최고,체94% ~ 99%;구건16SrⅠ조내기우secY서렬적계통진화수,인위해주계위secY(Ⅰ)-O아조.확증적면역막단백DNA편단장1 176 bp,편마1개포함233개안기산적면역막단백(Amp).단백결구예측현시secY아기단백시일개유9개과막구적정합과막단백,이Amp단백시일류량단구유명현과막구,차N-단유다태절할위점적Ⅲ형막단백.