计算机应用
計算機應用
계산궤응용
COMPUTER APPLICATION
2013年
6期
1540-1543,1552
,共5页
付继芸%贾伟乐%曹宗雁%王龙%叶煌%迟学斌
付繼蕓%賈偉樂%曹宗雁%王龍%葉煌%遲學斌
부계예%가위악%조종안%왕룡%협황%지학빈
第一性原理%密度泛函理论%赝势平面波%非局部映射势能%GPU加速
第一性原理%密度汎函理論%贗勢平麵波%非跼部映射勢能%GPU加速
제일성원리%밀도범함이론%안세평면파%비국부영사세능%GPU가속
平面波赝势密度泛函(PWP-DFT)计算是材料计算中应用最广泛的方法,其中映射计算是PWP-DFT方法求解自洽迭代中重要的一部分.针对映射势能计算成为软件加速的瓶颈,提出了针对该部分的图形处理器(GPU)加速算法,其中考虑GPU的特点:1)使用了新的并行机制求解非局部映射势能；2)重新设计了数据分布结构；3)减少内存的使用；4)提出了一种解决算法中数据相关问题的方法.最终获得了18～57倍加速,使每步分子动力学模拟最终降为12s.详细分析了该模块在GPU平台上的测试时间,同时对该算法在GPU集群上的计算瓶颈进行了讨论.
平麵波贗勢密度汎函(PWP-DFT)計算是材料計算中應用最廣汎的方法,其中映射計算是PWP-DFT方法求解自洽迭代中重要的一部分.針對映射勢能計算成為軟件加速的瓶頸,提齣瞭針對該部分的圖形處理器(GPU)加速算法,其中攷慮GPU的特點:1)使用瞭新的併行機製求解非跼部映射勢能；2)重新設計瞭數據分佈結構；3)減少內存的使用；4)提齣瞭一種解決算法中數據相關問題的方法.最終穫得瞭18～57倍加速,使每步分子動力學模擬最終降為12s.詳細分析瞭該模塊在GPU平檯上的測試時間,同時對該算法在GPU集群上的計算瓶頸進行瞭討論.
평면파안세밀도범함(PWP-DFT)계산시재료계산중응용최엄범적방법,기중영사계산시PWP-DFT방법구해자흡질대중중요적일부분.침대영사세능계산성위연건가속적병경,제출료침대해부분적도형처리기(GPU)가속산법,기중고필GPU적특점:1)사용료신적병행궤제구해비국부영사세능；2)중신설계료수거분포결구；3)감소내존적사용；4)제출료일충해결산법중수거상관문제적방법.최종획득료18～57배가속,사매보분자동역학모의최종강위12s.상세분석료해모괴재GPU평태상적측시시간,동시대해산법재GPU집군상적계산병경진행료토론.
