中华实用儿科临床杂志
中華實用兒科臨床雜誌
중화실용인과림상잡지
Journal of Applied Clinical Pediatrics
2013年
7期
496-500
,共5页
史春梅%徐广峰%陈玲%赵亚萍%倪毓辉%杨蕾%季晨博%郭锡熔
史春梅%徐廣峰%陳玲%趙亞萍%倪毓輝%楊蕾%季晨博%郭錫鎔
사춘매%서엄봉%진령%조아평%예육휘%양뢰%계신박%곽석용
hsa-miR-17-92 cluster%生物信息学%脂肪细胞%肥胖
hsa-miR-17-92 cluster%生物信息學%脂肪細胞%肥胖
hsa-miR-17-92 cluster%생물신식학%지방세포%비반
hsa-miR-17-92 cluster%Bioinformatics analysis%Human preadipocytes%Obesity
目的 对hsa-miR-17-92 cluster及其同源体进行系统的生物信息学分析,预测其可能参与的生物学过程,为深入研究其在脂肪细胞分化、肥胖发生等过程中的功能与机制奠定基础.方法 1.应用PubMed、Google等信息搜索工具查找hsa-miR-17-92 cluster及其同源体的所有研究,综述已有研究进展;2.应用miRBase获取hsa-miR-17-92 cluster及其同源体的各成员序列,并分析其序列特征及保守性;3.应用美国国家生物技术信息中心(NCBI) blast、NCBI mapviewer、基因组生物信息学(UCSC) Browser工具分析hsa-miR-17-92 cluster及其同源体所在基因组的序列特征;4.应用TargetScan5.1,PicTar及miRanda预测hsa-miR-17-92 cluster及其同源体靶基因,取三者预测结果的交集,进一步进行功能注释和Pathway富集分析.结果 1.现有研究提示hsa-miR-17-92 cluster及其同源体在脂肪细胞分化、肿瘤疾病、心脏及肺发育、免疫系统与血管形成等生物学过程中有重要作用;2.hsa-miR-17-92 cluster及其同源体进化上高度保守,根据种子序列同源性可分为4类,且在多物种间非常保守;3.hsa-miR-17-92 cluster及其同源体预测靶基因的功能与细胞周期、细胞黏附、Wnt、TGF-β信号、p53、丝裂原活化蛋白激酶等信号通路有较大的相关性,可能参与了前列腺癌、胰腺癌、结肠癌等多种疾病通路.结论 通过对hsa-miR-17-92 cluster及其同源体系统的生物信息学分析,初步阐明了hsa-miR-17-92 cluster及其同源体的基本生物学特征,并为hsa-miR-17-92 cluster后续研究提供了功能与机制的线索.
目的 對hsa-miR-17-92 cluster及其同源體進行繫統的生物信息學分析,預測其可能參與的生物學過程,為深入研究其在脂肪細胞分化、肥胖髮生等過程中的功能與機製奠定基礎.方法 1.應用PubMed、Google等信息搜索工具查找hsa-miR-17-92 cluster及其同源體的所有研究,綜述已有研究進展;2.應用miRBase穫取hsa-miR-17-92 cluster及其同源體的各成員序列,併分析其序列特徵及保守性;3.應用美國國傢生物技術信息中心(NCBI) blast、NCBI mapviewer、基因組生物信息學(UCSC) Browser工具分析hsa-miR-17-92 cluster及其同源體所在基因組的序列特徵;4.應用TargetScan5.1,PicTar及miRanda預測hsa-miR-17-92 cluster及其同源體靶基因,取三者預測結果的交集,進一步進行功能註釋和Pathway富集分析.結果 1.現有研究提示hsa-miR-17-92 cluster及其同源體在脂肪細胞分化、腫瘤疾病、心髒及肺髮育、免疫繫統與血管形成等生物學過程中有重要作用;2.hsa-miR-17-92 cluster及其同源體進化上高度保守,根據種子序列同源性可分為4類,且在多物種間非常保守;3.hsa-miR-17-92 cluster及其同源體預測靶基因的功能與細胞週期、細胞黏附、Wnt、TGF-β信號、p53、絲裂原活化蛋白激酶等信號通路有較大的相關性,可能參與瞭前列腺癌、胰腺癌、結腸癌等多種疾病通路.結論 通過對hsa-miR-17-92 cluster及其同源體繫統的生物信息學分析,初步闡明瞭hsa-miR-17-92 cluster及其同源體的基本生物學特徵,併為hsa-miR-17-92 cluster後續研究提供瞭功能與機製的線索.
목적 대hsa-miR-17-92 cluster급기동원체진행계통적생물신식학분석,예측기가능삼여적생물학과정,위심입연구기재지방세포분화、비반발생등과정중적공능여궤제전정기출.방법 1.응용PubMed、Google등신식수색공구사조hsa-miR-17-92 cluster급기동원체적소유연구,종술이유연구진전;2.응용miRBase획취hsa-miR-17-92 cluster급기동원체적각성원서렬,병분석기서렬특정급보수성;3.응용미국국가생물기술신식중심(NCBI) blast、NCBI mapviewer、기인조생물신식학(UCSC) Browser공구분석hsa-miR-17-92 cluster급기동원체소재기인조적서렬특정;4.응용TargetScan5.1,PicTar급miRanda예측hsa-miR-17-92 cluster급기동원체파기인,취삼자예측결과적교집,진일보진행공능주석화Pathway부집분석.결과 1.현유연구제시hsa-miR-17-92 cluster급기동원체재지방세포분화、종류질병、심장급폐발육、면역계통여혈관형성등생물학과정중유중요작용;2.hsa-miR-17-92 cluster급기동원체진화상고도보수,근거충자서렬동원성가분위4류,차재다물충간비상보수;3.hsa-miR-17-92 cluster급기동원체예측파기인적공능여세포주기、세포점부、Wnt、TGF-β신호、p53、사렬원활화단백격매등신호통로유교대적상관성,가능삼여료전렬선암、이선암、결장암등다충질병통로.결론 통과대hsa-miR-17-92 cluster급기동원체계통적생물신식학분석,초보천명료hsa-miR-17-92 cluster급기동원체적기본생물학특정,병위hsa-miR-17-92 cluster후속연구제공료공능여궤제적선색.