湖北农业科学
湖北農業科學
호북농업과학
2013年
4期
956-958,963
,共4页
拟南芥(Arabidopsis thaliana)%POT基因%密码子
擬南芥(Arabidopsis thaliana)%POT基因%密碼子
의남개(Arabidopsis thaliana)%POT기인%밀마자
Arabidopsis thaliana%POT gene%codon
运用CodonW程序对拟南芥(Arabidopsis thaliana)POT基因密码子组成、同义密码子使用频率和全长编码区密码子进行分析.结果表明,拟南芥POT基因密码子适应指数(CAI)与同义密码子第三位碱基含量(C3s)、密码子偏爱指数(CBI)均呈显著正相关(P＜0.05),与最优密码子使用频率(FOP)呈极显著正相关(P＜0.01).有效密码子数(ENC)与同义密码子第三位碱基含量(C3s)呈显著正相关(P＜0.05),与GC3s呈极显著正相关(P＜0.01),与同义密码子第三位碱基含量(T3s)呈极显著负相关(P＜0.01).拟南芥POT基因密码子使用相对概率(RSCU)＞1的密码子多以碱基A或T结尾.
運用CodonW程序對擬南芥(Arabidopsis thaliana)POT基因密碼子組成、同義密碼子使用頻率和全長編碼區密碼子進行分析.結果錶明,擬南芥POT基因密碼子適應指數(CAI)與同義密碼子第三位堿基含量(C3s)、密碼子偏愛指數(CBI)均呈顯著正相關(P＜0.05),與最優密碼子使用頻率(FOP)呈極顯著正相關(P＜0.01).有效密碼子數(ENC)與同義密碼子第三位堿基含量(C3s)呈顯著正相關(P＜0.05),與GC3s呈極顯著正相關(P＜0.01),與同義密碼子第三位堿基含量(T3s)呈極顯著負相關(P＜0.01).擬南芥POT基因密碼子使用相對概率(RSCU)＞1的密碼子多以堿基A或T結尾.
운용CodonW정서대의남개(Arabidopsis thaliana)POT기인밀마자조성、동의밀마자사용빈솔화전장편마구밀마자진행분석.결과표명,의남개POT기인밀마자괄응지수(CAI)여동의밀마자제삼위감기함량(C3s)、밀마자편애지수(CBI)균정현저정상관(P＜0.05),여최우밀마자사용빈솔(FOP)정겁현저정상관(P＜0.01).유효밀마자수(ENC)여동의밀마자제삼위감기함량(C3s)정현저정상관(P＜0.05),여GC3s정겁현저정상관(P＜0.01),여동의밀마자제삼위감기함량(T3s)정겁현저부상관(P＜0.01).의남개POT기인밀마자사용상대개솔(RSCU)＞1적밀마자다이감기A혹T결미.
