中国实验诊断学
中國實驗診斷學
중국실험진단학
CHINESE JOURNAL OF LABORATORY DIAGNOSIS
2013年
5期
793-798
,共6页
罗招云%陈强%杨立业%林敏%陈默蕊
囉招雲%陳彊%楊立業%林敏%陳默蕊
라초운%진강%양립업%림민%진묵예
人乳头瘤病毒%52型%L1基因%序列分析%多态性
人乳頭瘤病毒%52型%L1基因%序列分析%多態性
인유두류병독%52형%L1기인%서렬분석%다태성
目的 研究潮州地区优势型别人乳头瘤病毒(HPV)52型L1基因多态性.为基于L1基因工程疫苗的设计和应用提供理论依据.方法 采用核酸分子快速导流杂交分型技术(HybriMax)检出HPV52,提取101例HPV52单纯感染者宫颈脱落细胞DNA,通过4对特异性引物分别扩增HPV52-L1编码区全序列,进行测序及BLAST多态性分析.结果 本研究成功获得73条HPV52 L1基因全序列(1590 bp).该序列与天津参考株(GQ472848)的一致性为99%.在潮州地区发现的所有L1基因序列中有31个碱基是可发生变异的,其中25种为同义突变,6种为有义突变.根据基因多态性分东亚群和欧洲群2群.东亚群有13组,其中CZ52A105是本地最常见的变异株,占61.64% (45/73),该组称为潮州地方株,其编码序列与泰国清迈报道的IN141070株(HQ537743)完全匹配,其余各组(21/73)多态性国际上均尚未报道,他们均与天津报道的TJ49-52(GQ472848)株以及泰国报道的IN141070(HQ537743)株亲缘关系最近,有1~6个碱基不同.欧洲群有2组为 CZ52E928(2/73)和CZ52E136(5/73),其基因序列分别与德国REF(X74481)株和北美洲Qv03719(HQ537745)株的L1全序列完全匹配.结论 潮州地区HPV52-L1基因多态性与中国东南部和东南亚国家报道的类似,CZ52A105是潮州地方株.
目的 研究潮州地區優勢型彆人乳頭瘤病毒(HPV)52型L1基因多態性.為基于L1基因工程疫苗的設計和應用提供理論依據.方法 採用覈痠分子快速導流雜交分型技術(HybriMax)檢齣HPV52,提取101例HPV52單純感染者宮頸脫落細胞DNA,通過4對特異性引物分彆擴增HPV52-L1編碼區全序列,進行測序及BLAST多態性分析.結果 本研究成功穫得73條HPV52 L1基因全序列(1590 bp).該序列與天津參攷株(GQ472848)的一緻性為99%.在潮州地區髮現的所有L1基因序列中有31箇堿基是可髮生變異的,其中25種為同義突變,6種為有義突變.根據基因多態性分東亞群和歐洲群2群.東亞群有13組,其中CZ52A105是本地最常見的變異株,佔61.64% (45/73),該組稱為潮州地方株,其編碼序列與泰國清邁報道的IN141070株(HQ537743)完全匹配,其餘各組(21/73)多態性國際上均尚未報道,他們均與天津報道的TJ49-52(GQ472848)株以及泰國報道的IN141070(HQ537743)株親緣關繫最近,有1~6箇堿基不同.歐洲群有2組為 CZ52E928(2/73)和CZ52E136(5/73),其基因序列分彆與德國REF(X74481)株和北美洲Qv03719(HQ537745)株的L1全序列完全匹配.結論 潮州地區HPV52-L1基因多態性與中國東南部和東南亞國傢報道的類似,CZ52A105是潮州地方株.
목적 연구조주지구우세형별인유두류병독(HPV)52형L1기인다태성.위기우L1기인공정역묘적설계화응용제공이론의거.방법 채용핵산분자쾌속도류잡교분형기술(HybriMax)검출HPV52,제취101례HPV52단순감염자궁경탈락세포DNA,통과4대특이성인물분별확증HPV52-L1편마구전서렬,진행측서급BLAST다태성분석.결과 본연구성공획득73조HPV52 L1기인전서렬(1590 bp).해서렬여천진삼고주(GQ472848)적일치성위99%.재조주지구발현적소유L1기인서렬중유31개감기시가발생변이적,기중25충위동의돌변,6충위유의돌변.근거기인다태성분동아군화구주군2군.동아군유13조,기중CZ52A105시본지최상견적변이주,점61.64% (45/73),해조칭위조주지방주,기편마서렬여태국청매보도적IN141070주(HQ537743)완전필배,기여각조(21/73)다태성국제상균상미보도,타문균여천진보도적TJ49-52(GQ472848)주이급태국보도적IN141070(HQ537743)주친연관계최근,유1~6개감기불동.구주군유2조위 CZ52E928(2/73)화CZ52E136(5/73),기기인서렬분별여덕국REF(X74481)주화북미주Qv03719(HQ537745)주적L1전서렬완전필배.결론 조주지구HPV52-L1기인다태성여중국동남부화동남아국가보도적유사,CZ52A105시조주지방주.