大连海洋大学学报
大連海洋大學學報
대련해양대학학보
JOURNAL OF DALIAN FISHERIES UNIVERSITY
2013年
3期
224-229
,共6页
秦艳杰%李霞%张慧敏%王雪
秦豔傑%李霞%張慧敏%王雪
진염걸%리하%장혜민%왕설
刺参%体壁%抑制性消减杂交%cDNA文库%创伤和修复
刺參%體壁%抑製性消減雜交%cDNA文庫%創傷和脩複
자삼%체벽%억제성소감잡교%cDNA문고%창상화수복
Apostichopus japonicus%body wall%suppression subtractive hybridization%cDNA library%wound and recovery
应用抑制性消减杂交技术(SSH),构建了仿刺参Apostichopus japonicus(体质量为65 ~90 g)正常体壁及创伤修复(24、48、72、96、120 h后)体壁的消减cDNA文库,利用PCR和斑点杂交技术对文库进行筛选,随机挑取的768个克隆中发现292个阳性克隆,对其中信号强度较强的224个阳性克隆进行测序,得到208个有效EST序列.经BlastX工具对获得的EST与GenBank数据库进行比对分析,结果有171个EST序列与数据库中的基因同源(e≤0.001,相似性>40%),其中153个为未知基因,18个为已知功能或已命名基因,包括在创伤及修复的体壁中上调表达的β微管蛋白、微管蛋白α-1链、肌动蛋白、肌动蛋白ike 7B类似物、细胞色素c氧化酶亚基Ⅰ、tRNA假尿苷合成酶A、GTP酶、细胞分裂周期2类似蛋白、有丝分裂原活化蛋白激酶、homeobox蛋白、延伸因子1A、核糖体蛋白L30、核糖体蛋白L17、60S酸性核糖体蛋白PO、26S蛋白酶调节亚基、泛素特异性肽酶24、大肠癌血清抗原3、清道夫受体蛋白12等.本研究结果可为探讨刺参体壁再生过程和分子机理,以及筛选刺参体壁创伤修复过程中相关功能基因的研究提供基础依据.
應用抑製性消減雜交技術(SSH),構建瞭倣刺參Apostichopus japonicus(體質量為65 ~90 g)正常體壁及創傷脩複(24、48、72、96、120 h後)體壁的消減cDNA文庫,利用PCR和斑點雜交技術對文庫進行篩選,隨機挑取的768箇剋隆中髮現292箇暘性剋隆,對其中信號彊度較彊的224箇暘性剋隆進行測序,得到208箇有效EST序列.經BlastX工具對穫得的EST與GenBank數據庫進行比對分析,結果有171箇EST序列與數據庫中的基因同源(e≤0.001,相似性>40%),其中153箇為未知基因,18箇為已知功能或已命名基因,包括在創傷及脩複的體壁中上調錶達的β微管蛋白、微管蛋白α-1鏈、肌動蛋白、肌動蛋白ike 7B類似物、細胞色素c氧化酶亞基Ⅰ、tRNA假尿苷閤成酶A、GTP酶、細胞分裂週期2類似蛋白、有絲分裂原活化蛋白激酶、homeobox蛋白、延伸因子1A、覈糖體蛋白L30、覈糖體蛋白L17、60S痠性覈糖體蛋白PO、26S蛋白酶調節亞基、汎素特異性肽酶24、大腸癌血清抗原3、清道伕受體蛋白12等.本研究結果可為探討刺參體壁再生過程和分子機理,以及篩選刺參體壁創傷脩複過程中相關功能基因的研究提供基礎依據.
응용억제성소감잡교기술(SSH),구건료방자삼Apostichopus japonicus(체질량위65 ~90 g)정상체벽급창상수복(24、48、72、96、120 h후)체벽적소감cDNA문고,이용PCR화반점잡교기술대문고진행사선,수궤도취적768개극륭중발현292개양성극륭,대기중신호강도교강적224개양성극륭진행측서,득도208개유효EST서렬.경BlastX공구대획득적EST여GenBank수거고진행비대분석,결과유171개EST서렬여수거고중적기인동원(e≤0.001,상사성>40%),기중153개위미지기인,18개위이지공능혹이명명기인,포괄재창상급수복적체벽중상조표체적β미관단백、미관단백α-1련、기동단백、기동단백ike 7B유사물、세포색소c양화매아기Ⅰ、tRNA가뇨감합성매A、GTP매、세포분렬주기2유사단백、유사분렬원활화단백격매、homeobox단백、연신인자1A、핵당체단백L30、핵당체단백L17、60S산성핵당체단백PO、26S단백매조절아기、범소특이성태매24、대장암혈청항원3、청도부수체단백12등.본연구결과가위탐토자삼체벽재생과정화분자궤리,이급사선자삼체벽창상수복과정중상관공능기인적연구제공기출의거.