福建农业学报
福建農業學報
복건농업학보
FUJIAN JOURNAL OF AGRICULTURAL SCIENCES
2013年
4期
343-352
,共10页
史怀%刘波%陈峥%郑雪芳%潘志针%陈梅春%朱育菁
史懷%劉波%陳崢%鄭雪芳%潘誌針%陳梅春%硃育菁
사부%류파%진쟁%정설방%반지침%진매춘%주육정
代谢组学%青枯雷尔氏菌%致病性
代謝組學%青枯雷爾氏菌%緻病性
대사조학%청고뢰이씨균%치병성
metabonomic%ralstonia solanacearum%pathogenicity
采用基于LC/Q-TOF MS的代谢组学方法,对不同致病性青枯雷尔氏菌的胞外代谢物进行了分析,获得了具有显著性差异的代谢标志物,并采用PCA数据处理方法对不同致病性菌株进行分类,建立致病性的PLS-DA预测模型.结果表明,该方法可以从代谢水平上区分野生型强致病力菌株、野生型无致病力菌株以及强致病力菌株经Tn-5转座子插入导致致病力丧失的人工致弱突变菌株.对代谢标志物的差异分析结果表明,在无致病力菌株和Tn-5致弱菌株中,有12种代谢标志物与强致病力菌株具有显著性差异(P＜0.05,FC≥2),并表现出相同的丰度变化趋势,预示着这些代谢标志物可能与青枯雷尔氏菌的致病性有关.
採用基于LC/Q-TOF MS的代謝組學方法,對不同緻病性青枯雷爾氏菌的胞外代謝物進行瞭分析,穫得瞭具有顯著性差異的代謝標誌物,併採用PCA數據處理方法對不同緻病性菌株進行分類,建立緻病性的PLS-DA預測模型.結果錶明,該方法可以從代謝水平上區分野生型彊緻病力菌株、野生型無緻病力菌株以及彊緻病力菌株經Tn-5轉座子插入導緻緻病力喪失的人工緻弱突變菌株.對代謝標誌物的差異分析結果錶明,在無緻病力菌株和Tn-5緻弱菌株中,有12種代謝標誌物與彊緻病力菌株具有顯著性差異(P＜0.05,FC≥2),併錶現齣相同的豐度變化趨勢,預示著這些代謝標誌物可能與青枯雷爾氏菌的緻病性有關.
채용기우LC/Q-TOF MS적대사조학방법,대불동치병성청고뢰이씨균적포외대사물진행료분석,획득료구유현저성차이적대사표지물,병채용PCA수거처리방법대불동치병성균주진행분류,건립치병성적PLS-DA예측모형.결과표명,해방법가이종대사수평상구분야생형강치병력균주、야생형무치병력균주이급강치병력균주경Tn-5전좌자삽입도치치병력상실적인공치약돌변균주.대대사표지물적차이분석결과표명,재무치병력균주화Tn-5치약균주중,유12충대사표지물여강치병력균주구유현저성차이(P＜0.05,FC≥2),병표현출상동적봉도변화추세,예시착저사대사표지물가능여청고뢰이씨균적치병성유관.
