福建农业学报
福建農業學報
복건농업학보
FUJIAN JOURNAL OF AGRICULTURAL SCIENCES
2013年
4期
301-308
,共8页
王劭%程晓霞%陈少莺%朱小丽%陈仕龙%林锋强%李兆龙
王劭%程曉霞%陳少鶯%硃小麗%陳仕龍%林鋒彊%李兆龍
왕소%정효하%진소앵%주소려%진사룡%림봉강%리조룡
番鸭小鹅瘟病毒%NS蛋白%抗原表位%分子特征
番鴨小鵝瘟病毒%NS蛋白%抗原錶位%分子特徵
번압소아온병독%NS단백%항원표위%분자특정
MDGPV%NS protein%epitope%molecular characteristics
为获得番鸭小鹅瘟病毒弱毒株(MDGPV-D)非结构蛋白NS基因的相关信息,根据已发表的MDGPV-PT株全基因序列,应用DNAStar分子生物学软件设计1对引物,采用高保真PCR技术扩增MDGPV-D株NS全基因序列.对番鸭小鹅瘟病毒疫苗弱毒D株(MDGPV-D) NS基因进行克隆、测序,并利用生物信息学技术分析MDGPV-D株NS蛋白的同源性、遗传衍化、N-糖基化位点、磷酸化位点、B细胞抗原表位、T细胞抗原表位及其二级结构.结果表明,D株NS全基因大小为1 884 hp,编码627个氨基酸(GenBank登录号:JF926696),与MDPV NS基因的亲缘性最近核苷酸及其推导氨基酸同源性分别为97.9％～98.6％,97.6％～98.2％；MDGPV-D株NS蛋白具有3个潜在的N-糖基化位点和27个磷酸化位点,可能存在11个B细胞抗原表位,13个CD8+ CTL表位,10个CD4+ Th抗原表位；二级结构分析显示,α螺旋和无规则卷曲含量高,分别为40.67％、41.15％,而β转角仅占4.63％.与亲本强毒PT株相比,弱毒D株的NS蛋白存在2个定点突变,分别位于核苷三磷酸区域(第338位氨基酸)与CD4+ Th抗原表位(第225位氨基酸).
為穫得番鴨小鵝瘟病毒弱毒株(MDGPV-D)非結構蛋白NS基因的相關信息,根據已髮錶的MDGPV-PT株全基因序列,應用DNAStar分子生物學軟件設計1對引物,採用高保真PCR技術擴增MDGPV-D株NS全基因序列.對番鴨小鵝瘟病毒疫苗弱毒D株(MDGPV-D) NS基因進行剋隆、測序,併利用生物信息學技術分析MDGPV-D株NS蛋白的同源性、遺傳衍化、N-糖基化位點、燐痠化位點、B細胞抗原錶位、T細胞抗原錶位及其二級結構.結果錶明,D株NS全基因大小為1 884 hp,編碼627箇氨基痠(GenBank登錄號:JF926696),與MDPV NS基因的親緣性最近覈苷痠及其推導氨基痠同源性分彆為97.9％～98.6％,97.6％～98.2％；MDGPV-D株NS蛋白具有3箇潛在的N-糖基化位點和27箇燐痠化位點,可能存在11箇B細胞抗原錶位,13箇CD8+ CTL錶位,10箇CD4+ Th抗原錶位；二級結構分析顯示,α螺鏇和無規則捲麯含量高,分彆為40.67％、41.15％,而β轉角僅佔4.63％.與親本彊毒PT株相比,弱毒D株的NS蛋白存在2箇定點突變,分彆位于覈苷三燐痠區域(第338位氨基痠)與CD4+ Th抗原錶位(第225位氨基痠).
위획득번압소아온병독약독주(MDGPV-D)비결구단백NS기인적상관신식,근거이발표적MDGPV-PT주전기인서렬,응용DNAStar분자생물학연건설계1대인물,채용고보진PCR기술확증MDGPV-D주NS전기인서렬.대번압소아온병독역묘약독D주(MDGPV-D) NS기인진행극륭、측서,병이용생물신식학기술분석MDGPV-D주NS단백적동원성、유전연화、N-당기화위점、린산화위점、B세포항원표위、T세포항원표위급기이급결구.결과표명,D주NS전기인대소위1 884 hp,편마627개안기산(GenBank등록호:JF926696),여MDPV NS기인적친연성최근핵감산급기추도안기산동원성분별위97.9％～98.6％,97.6％～98.2％；MDGPV-D주NS단백구유3개잠재적N-당기화위점화27개린산화위점,가능존재11개B세포항원표위,13개CD8+ CTL표위,10개CD4+ Th항원표위；이급결구분석현시,α라선화무규칙권곡함량고,분별위40.67％、41.15％,이β전각부점4.63％.여친본강독PT주상비,약독D주적NS단백존재2개정점돌변,분별위우핵감삼린산구역(제338위안기산)여CD4+ Th항원표위(제225위안기산).
