滁州学院学报
滁州學院學報
저주학원학보
JOURNAL OF CHUZHOU UNIVERSITY
2013年
2期
80-87
,共8页
魏磊%柳建国%刘芳%诸立新
魏磊%柳建國%劉芳%諸立新
위뢰%류건국%류방%제립신
猫科动物%线粒体基因组%RNA 二级结构
貓科動物%線粒體基因組%RNA 二級結構
묘과동물%선립체기인조%RNA 이급결구
Felidae%Mitochondrial genome%RNA secondary structure
虎(Panthera tigris)、豹(Panthera pardus)、雪豹(Panthera uncia)、云豹(Neo f elis nebulosa)、猎豹(Acinonyx ju-batus)和家猫(Felis catus)线粒体基因组全序列全长分别为16990、16964、16773、16844、17011和17009 bp ,包括13个蛋白编码基因、22个 tRNA ,2个 rRNA 、一个非编码的控制区(D - loop)以及一个轻链复制起点(OL R),碱基含量 A + T 大于C + G 。在蛋白编码基因中,AT 偏向性在密码子的第二位点更加明显,这与大多数哺乳动物第三位点 AT 偏向性较高明显不同。蛋白质基因在密码子的使用上,ATG 为多数基因的起始密码子,TAA 为多数基因的终止密码子。预测的 tRNA二级结构显示,除 tRNASer (AGY)基因缺失“DHU”臂外,其余的 tRNA 基因序列都可以折叠成典型的“三叶草结构”。控制区位于 tRNAPro 和 tRNAPhe之间,控制区结构为高变Ⅰ区、中央保守Ⅱ区和保守序列Ⅲ区三个结构域。
虎(Panthera tigris)、豹(Panthera pardus)、雪豹(Panthera uncia)、雲豹(Neo f elis nebulosa)、獵豹(Acinonyx ju-batus)和傢貓(Felis catus)線粒體基因組全序列全長分彆為16990、16964、16773、16844、17011和17009 bp ,包括13箇蛋白編碼基因、22箇 tRNA ,2箇 rRNA 、一箇非編碼的控製區(D - loop)以及一箇輕鏈複製起點(OL R),堿基含量 A + T 大于C + G 。在蛋白編碼基因中,AT 偏嚮性在密碼子的第二位點更加明顯,這與大多數哺乳動物第三位點 AT 偏嚮性較高明顯不同。蛋白質基因在密碼子的使用上,ATG 為多數基因的起始密碼子,TAA 為多數基因的終止密碼子。預測的 tRNA二級結構顯示,除 tRNASer (AGY)基因缺失“DHU”臂外,其餘的 tRNA 基因序列都可以摺疊成典型的“三葉草結構”。控製區位于 tRNAPro 和 tRNAPhe之間,控製區結構為高變Ⅰ區、中央保守Ⅱ區和保守序列Ⅲ區三箇結構域。
호(Panthera tigris)、표(Panthera pardus)、설표(Panthera uncia)、운표(Neo f elis nebulosa)、작표(Acinonyx ju-batus)화가묘(Felis catus)선립체기인조전서렬전장분별위16990、16964、16773、16844、17011화17009 bp ,포괄13개단백편마기인、22개 tRNA ,2개 rRNA 、일개비편마적공제구(D - loop)이급일개경련복제기점(OL R),감기함량 A + T 대우C + G 。재단백편마기인중,AT 편향성재밀마자적제이위점경가명현,저여대다수포유동물제삼위점 AT 편향성교고명현불동。단백질기인재밀마자적사용상,ATG 위다수기인적기시밀마자,TAA 위다수기인적종지밀마자。예측적 tRNA이급결구현시,제 tRNASer (AGY)기인결실“DHU”비외,기여적 tRNA 기인서렬도가이절첩성전형적“삼협초결구”。공제구위우 tRNAPro 화 tRNAPhe지간,공제구결구위고변Ⅰ구、중앙보수Ⅱ구화보수서렬Ⅲ구삼개결구역。
The entire mitochondrial genome of Panthera tigris , Panthera pardus , Panthera uncia , Neo f elis nebulosa ,Acinonyx jubatus and Felis catus were 16990 、16964 、16773 、16844 、17011 and 17009 bp in length with A + T > C + G .Each mitochondrial DNA genomes included 13 protein - coding genes , 22 tRNA ,two rRNA ,one OL R and one control region .AT base preference was unique to the second site of the codon in protein - coding region which obviously differentiated from that of other mammals . Most protein coding genes of the mitochondrial genome started with ATG codon .For terminate codon usage ,most of genes terminate with codons TAA .The secondary structures of 22 tRNA were predic-ted ,tRNA can form typical cloverleaf - shaped structure except tRNA Ser (AGY) with an absence of "DHU"arm .The control region located between tRNA Pro and tRNA Phe with three structure domains .