河南农业科学
河南農業科學
하남농업과학
JOURNAL OF HENAN AGRICULTURAL SCIENCES
2013年
6期
107-111
,共5页
田云芳%刘艺平%李涵%苏金乐
田雲芳%劉藝平%李涵%囌金樂
전운방%류예평%리함%소금악
蕙兰%肌动蛋白基因%克隆%序列分析
蕙蘭%肌動蛋白基因%剋隆%序列分析
혜란%기동단백기인%극륭%서렬분석
Cymbidium faberi%Actin%cloning%sequence analysis
持家基因Actin常被用作定量、半定量PCR试验的内参.为研究其他基因的调控机制或外源基因在蕙兰中的相对表达提供内参,根据GenBank已经登录的肌动蛋白(Actin)基因的同源核苷酸保守序列,设计简并引物,利用RT-PCR的方法,以蕙兰花蕾期的花葶为材料,克隆了4个Actin基因片段.序列分析结果表明,4个Actin基因片段长度均为1 062 bp,编码354个氨基酸,具有Actin基因的标记位点:肌动蛋白(YVGDEAQs.KRG和WISKaEYDE)和肌动蛋白类似物(LLTEApLNPkaNR).各片段之间同源性高达95.97%,经BLAST分析,与文心兰同源性可达94%.其氨基酸序列与萼脊兰(AED94091.1)和蝴蝶兰(AAF71265.1)同源性达99%.得到的4个基因序列是Actin基因的同源片段,分别命名为CfACT1、CfACT2、CfACT3和CfACT5,并在GenBank注册,登录号分别为JN177718、JN177719、JN177720和JN177721.
持傢基因Actin常被用作定量、半定量PCR試驗的內參.為研究其他基因的調控機製或外源基因在蕙蘭中的相對錶達提供內參,根據GenBank已經登錄的肌動蛋白(Actin)基因的同源覈苷痠保守序列,設計簡併引物,利用RT-PCR的方法,以蕙蘭花蕾期的花葶為材料,剋隆瞭4箇Actin基因片段.序列分析結果錶明,4箇Actin基因片段長度均為1 062 bp,編碼354箇氨基痠,具有Actin基因的標記位點:肌動蛋白(YVGDEAQs.KRG和WISKaEYDE)和肌動蛋白類似物(LLTEApLNPkaNR).各片段之間同源性高達95.97%,經BLAST分析,與文心蘭同源性可達94%.其氨基痠序列與萼脊蘭(AED94091.1)和蝴蝶蘭(AAF71265.1)同源性達99%.得到的4箇基因序列是Actin基因的同源片段,分彆命名為CfACT1、CfACT2、CfACT3和CfACT5,併在GenBank註冊,登錄號分彆為JN177718、JN177719、JN177720和JN177721.
지가기인Actin상피용작정량、반정량PCR시험적내삼.위연구기타기인적조공궤제혹외원기인재혜란중적상대표체제공내삼,근거GenBank이경등록적기동단백(Actin)기인적동원핵감산보수서렬,설계간병인물,이용RT-PCR적방법,이혜란화뢰기적화정위재료,극륭료4개Actin기인편단.서렬분석결과표명,4개Actin기인편단장도균위1 062 bp,편마354개안기산,구유Actin기인적표기위점:기동단백(YVGDEAQs.KRG화WISKaEYDE)화기동단백유사물(LLTEApLNPkaNR).각편단지간동원성고체95.97%,경BLAST분석,여문심란동원성가체94%.기안기산서렬여악척란(AED94091.1)화호접란(AAF71265.1)동원성체99%.득도적4개기인서렬시Actin기인적동원편단,분별명명위CfACT1、CfACT2、CfACT3화CfACT5,병재GenBank주책,등록호분별위JN177718、JN177719、JN177720화JN177721.