渔业科学进展
漁業科學進展
어업과학진전
MARINE FISHERIES RESEARCH
2013年
3期
21-28
,共8页
崔文涛%刘立芹%李红梅%吕振明%吴常文
崔文濤%劉立芹%李紅梅%呂振明%吳常文
최문도%류립근%리홍매%려진명%오상문
蛸亚科%COⅡ基因%分子系统进化
蛸亞科%COⅡ基因%分子繫統進化
소아과%COⅡ기인%분자계통진화
Octopodinae%CO Ⅱ%Molecular phylogenetic analysis
为探讨我国近海蛸亚科(Octopodinae)动物的系统进化关系,本研究通过PCR扩增得到了东海区蛸亚科2属12种蛸类的线粒体COⅡ基因部分序列.纯化后测序,利用多个生物软件对序列变异和碱基组成进行分析.Kimura双参数法计算遗传距离,并结合GenBank上相关头足类同源序列构建NJ、UPGMA系统树.结果表明,蛸类COⅡ基因符合一般线粒体基因A+T含量较高的特点,有较为明显的反G偏倚.其变异位点较多的集中在第三位,编码的氨基酸序列变异位点较少.遗传距离分析表明,所得物种的遗传距离介于0.000与0.232 3之间,且大多位于0.140 0~0.200 0之间.聚类分析表明,所研究蛸类被明显地聚为两大类,即以真蛸为代表的长腕类和以砂蛸为代表的短腕类,证明了蛸属的非单系性.探讨了部分蛸类的分类地位,并就COⅡ基因在头足类系统进化研究的应用潜力进行了剖析.
為探討我國近海蛸亞科(Octopodinae)動物的繫統進化關繫,本研究通過PCR擴增得到瞭東海區蛸亞科2屬12種蛸類的線粒體COⅡ基因部分序列.純化後測序,利用多箇生物軟件對序列變異和堿基組成進行分析.Kimura雙參數法計算遺傳距離,併結閤GenBank上相關頭足類同源序列構建NJ、UPGMA繫統樹.結果錶明,蛸類COⅡ基因符閤一般線粒體基因A+T含量較高的特點,有較為明顯的反G偏倚.其變異位點較多的集中在第三位,編碼的氨基痠序列變異位點較少.遺傳距離分析錶明,所得物種的遺傳距離介于0.000與0.232 3之間,且大多位于0.140 0~0.200 0之間.聚類分析錶明,所研究蛸類被明顯地聚為兩大類,即以真蛸為代錶的長腕類和以砂蛸為代錶的短腕類,證明瞭蛸屬的非單繫性.探討瞭部分蛸類的分類地位,併就COⅡ基因在頭足類繫統進化研究的應用潛力進行瞭剖析.
위탐토아국근해소아과(Octopodinae)동물적계통진화관계,본연구통과PCR확증득도료동해구소아과2속12충소류적선립체COⅡ기인부분서렬.순화후측서,이용다개생물연건대서렬변이화감기조성진행분석.Kimura쌍삼수법계산유전거리,병결합GenBank상상관두족류동원서렬구건NJ、UPGMA계통수.결과표명,소류COⅡ기인부합일반선립체기인A+T함량교고적특점,유교위명현적반G편의.기변이위점교다적집중재제삼위,편마적안기산서렬변이위점교소.유전거리분석표명,소득물충적유전거리개우0.000여0.232 3지간,차대다위우0.140 0~0.200 0지간.취류분석표명,소연구소류피명현지취위량대류,즉이진소위대표적장완류화이사소위대표적단완류,증명료소속적비단계성.탐토료부분소류적분류지위,병취COⅡ기인재두족류계통진화연구적응용잠력진행료부석.