畜牧兽医学报
畜牧獸醫學報
축목수의학보
2013年
8期
1219-1228
,共10页
刘建%刘文博%吴晓云%阎萍%梁春年
劉建%劉文博%吳曉雲%閻萍%樑春年
류건%류문박%오효운%염평%량춘년
牦牛%CART基因%克隆%多态性%RNA二级结构
牦牛%CART基因%剋隆%多態性%RNA二級結構
모우%CART기인%극륭%다태성%RNA이급결구
yak%CART gene%clone%polymorphism%RNA secondary structure
旨在克隆牦牛可卡因-苯丙胺调节转录肽基因(Cocaine-and amphetamine-regulated transcript,CART),获得基因全长序列并分析基因结构和相关遗传变异,检测单核苷酸多态性(SNP)位点在不同品种牦牛群体中的分布,通过生物信息学相关方法分析预测SNP位点对CART基因表达的影响,为牦牛CART基因功能研究奠定基础.以243头大通牦牛、208头天祝牦牛、208头甘南牦牛和53头帕里牦牛血样为材料,提取基因组DNA,克隆出牦牛CART基因全长序列;运用高分辨率熔解曲线分析技术(High-resolution melting,HRM)检测CART基因4个SNPs在4个牦牛品种中的分布,进行遗传统计分析,并应用生物信息学分析SNPs可能对基因功能产生的影响.本研究发现,牦牛CART基因4个SNPs,1个位于基因上游序列、1个位于内含子、2个位于3'-UTR.x2检验表明,除大通牦牛V-221位点和甘南牦牛V1816位点外,其他所有群体各个位点都处于哈代-温伯格平衡(P＞0.05).群体遗传学分析显示,V168和V1816位点属于中度多态,V-221和V1791属于低度多态,单倍型C属于优势单倍型.生物信息分析发现,V1791和V1816位点碱基变化导致RNA二级结构发生变化,可能会对CART基因的表达产生影响.
旨在剋隆牦牛可卡因-苯丙胺調節轉錄肽基因(Cocaine-and amphetamine-regulated transcript,CART),穫得基因全長序列併分析基因結構和相關遺傳變異,檢測單覈苷痠多態性(SNP)位點在不同品種牦牛群體中的分佈,通過生物信息學相關方法分析預測SNP位點對CART基因錶達的影響,為牦牛CART基因功能研究奠定基礎.以243頭大通牦牛、208頭天祝牦牛、208頭甘南牦牛和53頭帕裏牦牛血樣為材料,提取基因組DNA,剋隆齣牦牛CART基因全長序列;運用高分辨率鎔解麯線分析技術(High-resolution melting,HRM)檢測CART基因4箇SNPs在4箇牦牛品種中的分佈,進行遺傳統計分析,併應用生物信息學分析SNPs可能對基因功能產生的影響.本研究髮現,牦牛CART基因4箇SNPs,1箇位于基因上遊序列、1箇位于內含子、2箇位于3'-UTR.x2檢驗錶明,除大通牦牛V-221位點和甘南牦牛V1816位點外,其他所有群體各箇位點都處于哈代-溫伯格平衡(P＞0.05).群體遺傳學分析顯示,V168和V1816位點屬于中度多態,V-221和V1791屬于低度多態,單倍型C屬于優勢單倍型.生物信息分析髮現,V1791和V1816位點堿基變化導緻RNA二級結構髮生變化,可能會對CART基因的錶達產生影響.
지재극륭모우가잡인-분병알조절전록태기인(Cocaine-and amphetamine-regulated transcript,CART),획득기인전장서렬병분석기인결구화상관유전변이,검측단핵감산다태성(SNP)위점재불동품충모우군체중적분포,통과생물신식학상관방법분석예측SNP위점대CART기인표체적영향,위모우CART기인공능연구전정기출.이243두대통모우、208두천축모우、208두감남모우화53두파리모우혈양위재료,제취기인조DNA,극륭출모우CART기인전장서렬;운용고분변솔용해곡선분석기술(High-resolution melting,HRM)검측CART기인4개SNPs재4개모우품충중적분포,진행유전통계분석,병응용생물신식학분석SNPs가능대기인공능산생적영향.본연구발현,모우CART기인4개SNPs,1개위우기인상유서렬、1개위우내함자、2개위우3'-UTR.x2검험표명,제대통모우V-221위점화감남모우V1816위점외,기타소유군체각개위점도처우합대-온백격평형(P＞0.05).군체유전학분석현시,V168화V1816위점속우중도다태,V-221화V1791속우저도다태,단배형C속우우세단배형.생물신식분석발현,V1791화V1816위점감기변화도치RNA이급결구발생변화,가능회대CART기인적표체산생영향.
