畜牧兽医学报
畜牧獸醫學報
축목수의학보
2013年
8期
1205-1212
,共8页
杨永强%焦仁刚%龚俞%谢海强%惠嫣婷%张依裕%肖超能%刘若余
楊永彊%焦仁剛%龔俞%謝海彊%惠嫣婷%張依裕%肖超能%劉若餘
양영강%초인강%공유%사해강%혜언정%장의유%초초능%류약여
STAT3%SNP%启动子%务川黑牛%生长性状%关联分析
STAT3%SNP%啟動子%務川黑牛%生長性狀%關聯分析
STAT3%SNP%계동자%무천흑우%생장성상%관련분석
STAT3%SNP%promoter%Wuchuan Black cattle%growth trait%association analysis
为筛选STAT3基因启动子区SNPs及研究其对启动子功能元件和体尺性状的影响.选择品种差异较大的贵州荷斯坦奶牛和务川黑牛构建不同DNA池,直接测序筛选SNP位点,PCR-RFLP进行验证和基因分型,并利用114头务川黑牛个体分析SNPs位点与8个体尺性状的相关性.结果表明:STAT3基因5 '调控区存在7个新SNPs位点,分别为:G-449A、C-341A、A-322G、C-246A、G-240A、C-225T、A-103T,提交SNP数据库得到登录号.生物信息学软件预测得到STAT3基因核心启动子区和CpG岛,SNP位点导致附近大量转录因子结合位点消失和新位点产生.多态性位点对转录因子结合位点有显著影响,但并不改变CpG岛大小.关联性分析结果表明,A-322G对务川黑牛体重有极显著影响(P＜0.01),A等位基因为有利等位基因.与AA或GG纯合基因型相比,AG基因型个体有更出色的体重性状.A-322G可能作为影响肉牛生长性状的重要功能性SNP,STAT3基因可能作为肉牛选种选育的候选基因,研究结果为进一步确定STAT3基因功能奠定试验基础.
為篩選STAT3基因啟動子區SNPs及研究其對啟動子功能元件和體呎性狀的影響.選擇品種差異較大的貴州荷斯坦奶牛和務川黑牛構建不同DNA池,直接測序篩選SNP位點,PCR-RFLP進行驗證和基因分型,併利用114頭務川黑牛箇體分析SNPs位點與8箇體呎性狀的相關性.結果錶明:STAT3基因5 '調控區存在7箇新SNPs位點,分彆為:G-449A、C-341A、A-322G、C-246A、G-240A、C-225T、A-103T,提交SNP數據庫得到登錄號.生物信息學軟件預測得到STAT3基因覈心啟動子區和CpG島,SNP位點導緻附近大量轉錄因子結閤位點消失和新位點產生.多態性位點對轉錄因子結閤位點有顯著影響,但併不改變CpG島大小.關聯性分析結果錶明,A-322G對務川黑牛體重有極顯著影響(P＜0.01),A等位基因為有利等位基因.與AA或GG純閤基因型相比,AG基因型箇體有更齣色的體重性狀.A-322G可能作為影響肉牛生長性狀的重要功能性SNP,STAT3基因可能作為肉牛選種選育的候選基因,研究結果為進一步確定STAT3基因功能奠定試驗基礎.
위사선STAT3기인계동자구SNPs급연구기대계동자공능원건화체척성상적영향.선택품충차이교대적귀주하사탄내우화무천흑우구건불동DNA지,직접측서사선SNP위점,PCR-RFLP진행험증화기인분형,병이용114두무천흑우개체분석SNPs위점여8개체척성상적상관성.결과표명:STAT3기인5 '조공구존재7개신SNPs위점,분별위:G-449A、C-341A、A-322G、C-246A、G-240A、C-225T、A-103T,제교SNP수거고득도등록호.생물신식학연건예측득도STAT3기인핵심계동자구화CpG도,SNP위점도치부근대량전록인자결합위점소실화신위점산생.다태성위점대전록인자결합위점유현저영향,단병불개변CpG도대소.관련성분석결과표명,A-322G대무천흑우체중유겁현저영향(P＜0.01),A등위기인위유리등위기인.여AA혹GG순합기인형상비,AG기인형개체유경출색적체중성상.A-322G가능작위영향육우생장성상적중요공능성SNP,STAT3기인가능작위육우선충선육적후선기인,연구결과위진일보학정STAT3기인공능전정시험기출.
