计算机与应用化学
計算機與應用化學
계산궤여응용화학
COMPUTERS AND APPLIED CHEMISTRY
2013年
1期
43-47
,共5页
王青%梅虎%张亚兰%潘显超%谭文%晁丽
王青%梅虎%張亞蘭%潘顯超%譚文%晁麗
왕청%매호%장아란%반현초%담문%조려
阿巴卡韦%HLA-B*5701%HLA-B*5801%多肽%亲和活性%支持向量机
阿巴卡韋%HLA-B*5701%HLA-B*5801%多肽%親和活性%支持嚮量機
아파잡위%HLA-B*5701%HLA-B*5801%다태%친화활성%지지향량궤
Abacavir%HLA-B*5701%HLA-B*5801%peptide%affinity%support vector machine
基于VHSE(Principal component score vector of hydrophobic,steric,and electronic properties)结构表征方法,采用支持向量机结合遗传算法变量筛选技术,分别建立B*5701和B*5801多肽亲和活性的分类预测模型,其最优线性模型内部验证的灵敏度(Sensitivity,Sen)、特异性(Specificity,Spe)、接受者操作特征曲线下面积(Area under receiver operating characteristics curve,AUC)和马休斯相关系数(Matthews coefficient of correlation,MCC)分别为77.29％、93.99％、93.02％、67.65％ (B*5701)和78.08％、89.62％、88.34％、64.73％ (B*5801);外部验证的Sen、Spe、AUC和MCC分别为80.02％、94.53％、94.62％、72.09％ (B*5701)和77.43％、90.79％、87.98％、66.20％ (B*5801).依据最优模型,分别对B*5701和B*5801配体的亲和特性进行了细致的比较和分析,研究结果可为Abacavir的HLA-B*5701限制性药物毒副作用(Serious Adverse Drug Reactions,SADR)机理研究提供重要的参考依据.
基于VHSE(Principal component score vector of hydrophobic,steric,and electronic properties)結構錶徵方法,採用支持嚮量機結閤遺傳算法變量篩選技術,分彆建立B*5701和B*5801多肽親和活性的分類預測模型,其最優線性模型內部驗證的靈敏度(Sensitivity,Sen)、特異性(Specificity,Spe)、接受者操作特徵麯線下麵積(Area under receiver operating characteristics curve,AUC)和馬休斯相關繫數(Matthews coefficient of correlation,MCC)分彆為77.29％、93.99％、93.02％、67.65％ (B*5701)和78.08％、89.62％、88.34％、64.73％ (B*5801);外部驗證的Sen、Spe、AUC和MCC分彆為80.02％、94.53％、94.62％、72.09％ (B*5701)和77.43％、90.79％、87.98％、66.20％ (B*5801).依據最優模型,分彆對B*5701和B*5801配體的親和特性進行瞭細緻的比較和分析,研究結果可為Abacavir的HLA-B*5701限製性藥物毒副作用(Serious Adverse Drug Reactions,SADR)機理研究提供重要的參攷依據.
기우VHSE(Principal component score vector of hydrophobic,steric,and electronic properties)결구표정방법,채용지지향량궤결합유전산법변량사선기술,분별건립B*5701화B*5801다태친화활성적분류예측모형,기최우선성모형내부험증적령민도(Sensitivity,Sen)、특이성(Specificity,Spe)、접수자조작특정곡선하면적(Area under receiver operating characteristics curve,AUC)화마휴사상관계수(Matthews coefficient of correlation,MCC)분별위77.29％、93.99％、93.02％、67.65％ (B*5701)화78.08％、89.62％、88.34％、64.73％ (B*5801);외부험증적Sen、Spe、AUC화MCC분별위80.02％、94.53％、94.62％、72.09％ (B*5701)화77.43％、90.79％、87.98％、66.20％ (B*5801).의거최우모형,분별대B*5701화B*5801배체적친화특성진행료세치적비교화분석,연구결과가위Abacavir적HLA-B*5701한제성약물독부작용(Serious Adverse Drug Reactions,SADR)궤리연구제공중요적삼고의거.
