山西中医学院学报
山西中醫學院學報
산서중의학원학보
JOURNAL OF SHANXI COLLEGE OF TRADITIONAL CHINESE MEDICINE
2013年
4期
56-58
,共3页
生物信息学%PPARγ%启动子%转录调控
生物信息學%PPARγ%啟動子%轉錄調控
생물신식학%PPARγ%계동자%전록조공
目的:对人类PPARγ基因5'-非翻译区进行生物信息学的分析.方法:通过搜索网络数据库,得到PPARγ基因翻译起始点上游约2 kb的序列.运用PROMOTER SCAN分析该序列可能的启动子区域,利用在线分析软件EMBOSS、MethPrimer和CpG Island Searcher分析该序列潜在的CpG岛,运用TFSEARCH软件分析该序列潜在的转录因子结合位点.结果:人类PPARγ基因5'-非翻译区转录起始位点上游反向链2 425到2 175区具有启动子活性,在启动子上具有TATA盒.PPARγ基因5'-非翻译区转录起始位点上游2 kb序列存在包括MyoD、HSF和Nkx-2等19个转录因子的潜在结合位点,不存在CpG岛.结论:该实验为后续的PPARγ基因的转录调控研究奠定基础.
目的:對人類PPARγ基因5'-非翻譯區進行生物信息學的分析.方法:通過搜索網絡數據庫,得到PPARγ基因翻譯起始點上遊約2 kb的序列.運用PROMOTER SCAN分析該序列可能的啟動子區域,利用在線分析軟件EMBOSS、MethPrimer和CpG Island Searcher分析該序列潛在的CpG島,運用TFSEARCH軟件分析該序列潛在的轉錄因子結閤位點.結果:人類PPARγ基因5'-非翻譯區轉錄起始位點上遊反嚮鏈2 425到2 175區具有啟動子活性,在啟動子上具有TATA盒.PPARγ基因5'-非翻譯區轉錄起始位點上遊2 kb序列存在包括MyoD、HSF和Nkx-2等19箇轉錄因子的潛在結閤位點,不存在CpG島.結論:該實驗為後續的PPARγ基因的轉錄調控研究奠定基礎.
목적:대인류PPARγ기인5'-비번역구진행생물신식학적분석.방법:통과수색망락수거고,득도PPARγ기인번역기시점상유약2 kb적서렬.운용PROMOTER SCAN분석해서렬가능적계동자구역,이용재선분석연건EMBOSS、MethPrimer화CpG Island Searcher분석해서렬잠재적CpG도,운용TFSEARCH연건분석해서렬잠재적전록인자결합위점.결과:인류PPARγ기인5'-비번역구전록기시위점상유반향련2 425도2 175구구유계동자활성,재계동자상구유TATA합.PPARγ기인5'-비번역구전록기시위점상유2 kb서렬존재포괄MyoD、HSF화Nkx-2등19개전록인자적잠재결합위점,불존재CpG도.결론:해실험위후속적PPARγ기인적전록조공연구전정기출.
