西南农业学报
西南農業學報
서남농업학보
SOUTHWEST CHINA JOURNAL OF AGRICULTURAL SCIENCES
2013年
5期
2127-2132
,共6页
彭金霞%赵永贞%韦嫔媛%蒋伟明%李咏梅%陈秀荔%殷勤%陈晓汉
彭金霞%趙永貞%韋嬪媛%蔣偉明%李詠梅%陳秀荔%慇勤%陳曉漢
팽금하%조영정%위빈원%장위명%리영매%진수려%은근%진효한
凡纳滨对虾%EST库%低温胁迫
凡納濱對蝦%EST庫%低溫脅迫
범납빈대하%EST고%저온협박
Litopenaeus vannmei%EST library%Cold stress
通过搜索凡纳滨对虾EST数据库,获得3个包含完整开放阅读框的sHSP cDNA序列.对3个sHSP cDNA和相应蛋白序列进行多序列比对发现,3个sHSP的cDNA序列同源性非常高,均达到95％以上,但在开放阅读框第376 bp之后,3个基因间有多个插入和缺失突变,使编码的蛋白序列在C端有较大差异,sHSP-1与sHSP-2、sHSP-3蛋白的同源性只有86.5％和78.7％.不同物种多个sHSP蛋白序列构建的系统进化树显示,3个sHSP与其他物种的HSP20.6、HSP21.4和HSP Beta亲缘关系都很近,推测不同物种sHSP起源相似,且同一物种的不同sHSP通过基因复制产生.运用荧光定量PCR分析了sHSP-1和sHSP-2基因在凡纳滨对虾不同组织及低温胁迫处理下的表达,结果显示,sHSP-1和sHSP-2均在肌肉组织中优势表达,并在低温诱导对虾肌肉组织中呈上调表达,暗示sHSP基因可能在对虾应对低温时发挥功能.
通過搜索凡納濱對蝦EST數據庫,穫得3箇包含完整開放閱讀框的sHSP cDNA序列.對3箇sHSP cDNA和相應蛋白序列進行多序列比對髮現,3箇sHSP的cDNA序列同源性非常高,均達到95％以上,但在開放閱讀框第376 bp之後,3箇基因間有多箇插入和缺失突變,使編碼的蛋白序列在C耑有較大差異,sHSP-1與sHSP-2、sHSP-3蛋白的同源性隻有86.5％和78.7％.不同物種多箇sHSP蛋白序列構建的繫統進化樹顯示,3箇sHSP與其他物種的HSP20.6、HSP21.4和HSP Beta親緣關繫都很近,推測不同物種sHSP起源相似,且同一物種的不同sHSP通過基因複製產生.運用熒光定量PCR分析瞭sHSP-1和sHSP-2基因在凡納濱對蝦不同組織及低溫脅迫處理下的錶達,結果顯示,sHSP-1和sHSP-2均在肌肉組織中優勢錶達,併在低溫誘導對蝦肌肉組織中呈上調錶達,暗示sHSP基因可能在對蝦應對低溫時髮揮功能.
통과수색범납빈대하EST수거고,획득3개포함완정개방열독광적sHSP cDNA서렬.대3개sHSP cDNA화상응단백서렬진행다서렬비대발현,3개sHSP적cDNA서렬동원성비상고,균체도95％이상,단재개방열독광제376 bp지후,3개기인간유다개삽입화결실돌변,사편마적단백서렬재C단유교대차이,sHSP-1여sHSP-2、sHSP-3단백적동원성지유86.5％화78.7％.불동물충다개sHSP단백서렬구건적계통진화수현시,3개sHSP여기타물충적HSP20.6、HSP21.4화HSP Beta친연관계도흔근,추측불동물충sHSP기원상사,차동일물충적불동sHSP통과기인복제산생.운용형광정량PCR분석료sHSP-1화sHSP-2기인재범납빈대하불동조직급저온협박처리하적표체,결과현시,sHSP-1화sHSP-2균재기육조직중우세표체,병재저온유도대하기육조직중정상조표체,암시sHSP기인가능재대하응대저온시발휘공능.
