国际检验医学杂志
國際檢驗醫學雜誌
국제검험의학잡지
INTERNATIONAL JOURNAL OF LABORATORY MEDICINE
2014年
4期
463,466
,共2页
聂滨%欧阳龙%雷开健%逯心敏
聶濱%歐暘龍%雷開健%逯心敏
섭빈%구양룡%뢰개건%록심민
HIV%基因分型%邻位相连法
HIV%基因分型%鄰位相連法
HIV%기인분형%린위상련법
HIV%genotype%neighbor joining method
目的 为进一步确定HIV-1M组基因分型的最佳区域.方法 从Genbank中筛选出对各成熟肽区域有注释来源,来自于不同国家地区的104条HIV-1M组全基因组序列.对序列的结构区域gag区、pol区、enV区及env的亚区域gp41和gp120分别建邻位相连(NJ)系统进化树.结果 pol区未能把D亚型和B亚型分开;gag区未把K亚型和F亚型分开;env区能对HIV-1M组正确分型;env的亚区域gp41未能把K亚型与H和F亚型分开,J亚型未与A亚型分开.env的亚区域gp120未能把J亚型与A1亚型分开.结论 用NJ系统进化树方法确定env区最能代表HIV-1M全基因组序列进行分型.
目的 為進一步確定HIV-1M組基因分型的最佳區域.方法 從Genbank中篩選齣對各成熟肽區域有註釋來源,來自于不同國傢地區的104條HIV-1M組全基因組序列.對序列的結構區域gag區、pol區、enV區及env的亞區域gp41和gp120分彆建鄰位相連(NJ)繫統進化樹.結果 pol區未能把D亞型和B亞型分開;gag區未把K亞型和F亞型分開;env區能對HIV-1M組正確分型;env的亞區域gp41未能把K亞型與H和F亞型分開,J亞型未與A亞型分開.env的亞區域gp120未能把J亞型與A1亞型分開.結論 用NJ繫統進化樹方法確定env區最能代錶HIV-1M全基因組序列進行分型.
목적 위진일보학정HIV-1M조기인분형적최가구역.방법 종Genbank중사선출대각성숙태구역유주석래원,래자우불동국가지구적104조HIV-1M조전기인조서렬.대서렬적결구구역gag구、pol구、enV구급env적아구역gp41화gp120분별건린위상련(NJ)계통진화수.결과 pol구미능파D아형화B아형분개;gag구미파K아형화F아형분개;env구능대HIV-1M조정학분형;env적아구역gp41미능파K아형여H화F아형분개,J아형미여A아형분개.env적아구역gp120미능파J아형여A1아형분개.결론 용NJ계통진화수방법학정env구최능대표HIV-1M전기인조서렬진행분형.
