西南林业大学学报
西南林業大學學報
서남임업대학학보
JOURNAL OF SOUTHWEST FORESTRY COLLEGE
2013年
2期
88-95
,共8页
原晓龙%周军%辛培尧%董娇%孟富宣%付海辉
原曉龍%週軍%辛培堯%董嬌%孟富宣%付海輝
원효룡%주군%신배요%동교%맹부선%부해휘
查尔酮异构酶%生物信息学分析%蛋白质功能预测
查爾酮異構酶%生物信息學分析%蛋白質功能預測
사이동이구매%생물신식학분석%단백질공능예측
chalcone isomerase%bioinformatics analysis%functional prediction of protein
根据GenBank上已登录的拟南芥、苹果杂交种、草莓、桃、沙梨的栽培种美人酥、葡萄、柑橘和玉米的查尔酮异构酶基因蛋白质氨基酸残基序列,应用生物软件对其组成成分、导肽、信号肽、跨膜结构域、疏水性与亲水性、蛋白质二级和三级结构以及功能域进行预测和分析.结果表明:8种植物的CHI不具有导肽,不存在信号肽,不具有跨膜结构,推测CHI可能定位于细胞质基质中发挥功能,多肽链总体表现为亲水性；有α-螺旋、β-转折、无规则卷曲和延伸链4种二级结构,除了无规则卷曲是桃的最主要二级元件外；其余7种植物均是α-螺旋为最主要的结构元件；8种植物可能均有1个查尔酮异构酶活性部位.
根據GenBank上已登錄的擬南芥、蘋果雜交種、草莓、桃、沙梨的栽培種美人酥、葡萄、柑橘和玉米的查爾酮異構酶基因蛋白質氨基痠殘基序列,應用生物軟件對其組成成分、導肽、信號肽、跨膜結構域、疏水性與親水性、蛋白質二級和三級結構以及功能域進行預測和分析.結果錶明:8種植物的CHI不具有導肽,不存在信號肽,不具有跨膜結構,推測CHI可能定位于細胞質基質中髮揮功能,多肽鏈總體錶現為親水性；有α-螺鏇、β-轉摺、無規則捲麯和延伸鏈4種二級結構,除瞭無規則捲麯是桃的最主要二級元件外；其餘7種植物均是α-螺鏇為最主要的結構元件；8種植物可能均有1箇查爾酮異構酶活性部位.
근거GenBank상이등록적의남개、평과잡교충、초매、도、사리적재배충미인소、포도、감귤화옥미적사이동이구매기인단백질안기산잔기서렬,응용생물연건대기조성성분、도태、신호태、과막결구역、소수성여친수성、단백질이급화삼급결구이급공능역진행예측화분석.결과표명:8충식물적CHI불구유도태,불존재신호태,불구유과막결구,추측CHI가능정위우세포질기질중발휘공능,다태련총체표현위친수성；유α-라선、β-전절、무규칙권곡화연신련4충이급결구,제료무규칙권곡시도적최주요이급원건외；기여7충식물균시α-라선위최주요적결구원건；8충식물가능균유1개사이동이구매활성부위.
