畜牧兽医学报
畜牧獸醫學報
축목수의학보
2013年
5期
681-689
,共9页
狄江%拉扎提·艾尼瓦尔%徐新明%张艳花%田可川%田月珍%吴伟伟%于丽娟%哈尼克孜·吐拉甫
狄江%拉扎提·艾尼瓦爾%徐新明%張豔花%田可川%田月珍%吳偉偉%于麗娟%哈尼剋孜·吐拉甫
적강%랍찰제·애니와이%서신명%장염화%전가천%전월진%오위위%우려연%합니극자·토랍보
细毛羊%纤维直径%基因表达%基因芯片
細毛羊%纖維直徑%基因錶達%基因芯片
세모양%섬유직경%기인표체%기인심편
fine wool sheep%fiber diameter%gene expression%microarray
为了筛选不同被毛纤维直径的细毛羊皮肤组织中的差异表达基因,本研究利用Agilent公司绵羊表达谱芯片和Affymetrix公司牛表达谱芯片对不同被毛纤维直径的细毛羊皮肤组织mRNA进行了芯片杂交;运用Significance Analysis of Microarrays (SAM)法对基因表达谱进行了差异分析;并通过分子注释系统平台(MAS3.0)对差异表达基因进行了功能富集类分析和调控通路分析;通过实时定量PCR对部分差异表达基因进行了验证.芯片试验共检测到267个差异表达的基因,其中上调基因106个,下调基因161个.Kegg和GO分析表明,参与细胞凋亡、增殖及分化、蛋白质代谢、Wnt信号通路以及羊毛角蛋白结构等生物学过程的多个基因表达水平发生了显著变化.所验证的差异表达基因的荧光定量PCR结果与芯片结果基本一致.结果表明,不同被毛纤维直径的细毛羊皮肤组织的基因表达谱存在差别,这些基因的不同表达可能通过改变皮肤毛囊和羊毛分化过程影响被毛纤维直径.这些基因的发现将为进一步筛选影响羊毛纤维直径性状的重要候选基因/分子标记提供研究基础.
為瞭篩選不同被毛纖維直徑的細毛羊皮膚組織中的差異錶達基因,本研究利用Agilent公司綿羊錶達譜芯片和Affymetrix公司牛錶達譜芯片對不同被毛纖維直徑的細毛羊皮膚組織mRNA進行瞭芯片雜交;運用Significance Analysis of Microarrays (SAM)法對基因錶達譜進行瞭差異分析;併通過分子註釋繫統平檯(MAS3.0)對差異錶達基因進行瞭功能富集類分析和調控通路分析;通過實時定量PCR對部分差異錶達基因進行瞭驗證.芯片試驗共檢測到267箇差異錶達的基因,其中上調基因106箇,下調基因161箇.Kegg和GO分析錶明,參與細胞凋亡、增殖及分化、蛋白質代謝、Wnt信號通路以及羊毛角蛋白結構等生物學過程的多箇基因錶達水平髮生瞭顯著變化.所驗證的差異錶達基因的熒光定量PCR結果與芯片結果基本一緻.結果錶明,不同被毛纖維直徑的細毛羊皮膚組織的基因錶達譜存在差彆,這些基因的不同錶達可能通過改變皮膚毛囊和羊毛分化過程影響被毛纖維直徑.這些基因的髮現將為進一步篩選影響羊毛纖維直徑性狀的重要候選基因/分子標記提供研究基礎.
위료사선불동피모섬유직경적세모양피부조직중적차이표체기인,본연구이용Agilent공사면양표체보심편화Affymetrix공사우표체보심편대불동피모섬유직경적세모양피부조직mRNA진행료심편잡교;운용Significance Analysis of Microarrays (SAM)법대기인표체보진행료차이분석;병통과분자주석계통평태(MAS3.0)대차이표체기인진행료공능부집류분석화조공통로분석;통과실시정량PCR대부분차이표체기인진행료험증.심편시험공검측도267개차이표체적기인,기중상조기인106개,하조기인161개.Kegg화GO분석표명,삼여세포조망、증식급분화、단백질대사、Wnt신호통로이급양모각단백결구등생물학과정적다개기인표체수평발생료현저변화.소험증적차이표체기인적형광정량PCR결과여심편결과기본일치.결과표명,불동피모섬유직경적세모양피부조직적기인표체보존재차별,저사기인적불동표체가능통과개변피부모낭화양모분화과정영향피모섬유직경.저사기인적발현장위진일보사선영향양모섬유직경성상적중요후선기인/분자표기제공연구기출.
