四川农业大学学报
四川農業大學學報
사천농업대학학보
JOURNAL OF SICHUAN AGRICULTURAL UNIVERSITY
2013年
1期
65-70
,共6页
李青芝%王滔%李明洲%蒋岸岸%白林
李青芝%王滔%李明洲%蔣岸岸%白林
리청지%왕도%리명주%장안안%백림
猪%皮下脂肪%内脏脂肪%脂肪酸组成%炎症%RNA-Seq
豬%皮下脂肪%內髒脂肪%脂肪痠組成%炎癥%RNA-Seq
저%피하지방%내장지방%지방산조성%염증%RNA-Seq
[目的]研究猪皮下脂肪和内脏脂肪的表型和代谢差异,找出差异转录本.[方法]选取长白母猪的皮下脂肪(背部皮下脂肪)和内脏脂肪(大网膜脂肪和肠系膜脂肪)进行表型测定及高通量转录组测序(RNA-Seq).[结果]①背部皮下脂肪体积最大,大网膜次之,肠系膜的脂肪体积最小;与皮下脂肪相比,内脏脂肪中饱和脂肪酸含量更高(P＜0.01)而不饱和脂肪酸的含量相对较低(P＜0.05);②转录组测序共获得30 532 913～33 479 707个唯一比对到基因组的读段(reads),鉴定了22 015个转录本,覆盖猪已注解转录本的80.2％,同时还发现4 583～4 765个新的转录本、936～1029个可变剪切、16 559个单核苷酸多态位点(SNPs)和1 481个插入/缺失位点(INDELs).③皮下脂肪和内脏脂肪间差异表达的基因共有183个,基因注释(GO)和代谢通路(Pathway)分析发现它们在不饱和脂肪酸合成、羧酸代谢和炎症反应过程中有重要作用.[结论]提供了猪皮下脂肪和内脏脂肪的完善转录组信息,获得了影响脂肪酸代谢的潜在候选基因,为进一步揭示皮下脂肪和内脏脂肪的功能特征与差异提供了数据基础.
[目的]研究豬皮下脂肪和內髒脂肪的錶型和代謝差異,找齣差異轉錄本.[方法]選取長白母豬的皮下脂肪(揹部皮下脂肪)和內髒脂肪(大網膜脂肪和腸繫膜脂肪)進行錶型測定及高通量轉錄組測序(RNA-Seq).[結果]①揹部皮下脂肪體積最大,大網膜次之,腸繫膜的脂肪體積最小;與皮下脂肪相比,內髒脂肪中飽和脂肪痠含量更高(P＜0.01)而不飽和脂肪痠的含量相對較低(P＜0.05);②轉錄組測序共穫得30 532 913～33 479 707箇唯一比對到基因組的讀段(reads),鑒定瞭22 015箇轉錄本,覆蓋豬已註解轉錄本的80.2％,同時還髮現4 583～4 765箇新的轉錄本、936～1029箇可變剪切、16 559箇單覈苷痠多態位點(SNPs)和1 481箇插入/缺失位點(INDELs).③皮下脂肪和內髒脂肪間差異錶達的基因共有183箇,基因註釋(GO)和代謝通路(Pathway)分析髮現它們在不飽和脂肪痠閤成、羧痠代謝和炎癥反應過程中有重要作用.[結論]提供瞭豬皮下脂肪和內髒脂肪的完善轉錄組信息,穫得瞭影響脂肪痠代謝的潛在候選基因,為進一步揭示皮下脂肪和內髒脂肪的功能特徵與差異提供瞭數據基礎.
[목적]연구저피하지방화내장지방적표형화대사차이,조출차이전록본.[방법]선취장백모저적피하지방(배부피하지방)화내장지방(대망막지방화장계막지방)진행표형측정급고통량전록조측서(RNA-Seq).[결과]①배부피하지방체적최대,대망막차지,장계막적지방체적최소;여피하지방상비,내장지방중포화지방산함량경고(P＜0.01)이불포화지방산적함량상대교저(P＜0.05);②전록조측서공획득30 532 913～33 479 707개유일비대도기인조적독단(reads),감정료22 015개전록본,복개저이주해전록본적80.2％,동시환발현4 583～4 765개신적전록본、936～1029개가변전절、16 559개단핵감산다태위점(SNPs)화1 481개삽입/결실위점(INDELs).③피하지방화내장지방간차이표체적기인공유183개,기인주석(GO)화대사통로(Pathway)분석발현타문재불포화지방산합성、최산대사화염증반응과정중유중요작용.[결론]제공료저피하지방화내장지방적완선전록조신식,획득료영향지방산대사적잠재후선기인,위진일보게시피하지방화내장지방적공능특정여차이제공료수거기출.
