检验医学
檢驗醫學
검험의학
LABORATORY MEDICINE
2014年
6期
593-596
,共4页
光滑念珠菌%基因分型%多位点序列分析%微卫星多态性分析
光滑唸珠菌%基因分型%多位點序列分析%微衛星多態性分析
광활념주균%기인분형%다위점서렬분석%미위성다태성분석
Candida glabrata%Genotype%Multilocus sequence typing%Microsatellite polymorphism
目的:评估微卫星多态性分析技术在临床光滑念珠菌基因分型中的作用。方法收集2011年1月至2012年12月仁济医院和东方医院临床分离的光滑念珠菌59株,采用多位点序列分析(MLST)和微卫星多态性分析技术进行基因分型,比较2种基因分型方法的结果和分辨力。结果59株光滑念珠菌经MLST分型得到6个序列型,其中ST-7型43株、ST-10型7株、ST-15型和ST-55型各3株、ST-3型2株、ST-43型1株,鉴别力指数(DP)为0.456;经微卫星多态性分析方法分为10型,其中A型25株、B型10株、C型8株、D型6株、E型3株、F型和G型各2株、H~J型各1株,DP为0.770。结论微卫星多态性分析方法简便、快速,分辨力高于MLST技术,可作为实验室基因分型的首选方法。
目的:評估微衛星多態性分析技術在臨床光滑唸珠菌基因分型中的作用。方法收集2011年1月至2012年12月仁濟醫院和東方醫院臨床分離的光滑唸珠菌59株,採用多位點序列分析(MLST)和微衛星多態性分析技術進行基因分型,比較2種基因分型方法的結果和分辨力。結果59株光滑唸珠菌經MLST分型得到6箇序列型,其中ST-7型43株、ST-10型7株、ST-15型和ST-55型各3株、ST-3型2株、ST-43型1株,鑒彆力指數(DP)為0.456;經微衛星多態性分析方法分為10型,其中A型25株、B型10株、C型8株、D型6株、E型3株、F型和G型各2株、H~J型各1株,DP為0.770。結論微衛星多態性分析方法簡便、快速,分辨力高于MLST技術,可作為實驗室基因分型的首選方法。
목적:평고미위성다태성분석기술재림상광활념주균기인분형중적작용。방법수집2011년1월지2012년12월인제의원화동방의원림상분리적광활념주균59주,채용다위점서렬분석(MLST)화미위성다태성분석기술진행기인분형,비교2충기인분형방법적결과화분변력。결과59주광활념주균경MLST분형득도6개서렬형,기중ST-7형43주、ST-10형7주、ST-15형화ST-55형각3주、ST-3형2주、ST-43형1주,감별력지수(DP)위0.456;경미위성다태성분석방법분위10형,기중A형25주、B형10주、C형8주、D형6주、E형3주、F형화G형각2주、H~J형각1주,DP위0.770。결론미위성다태성분석방법간편、쾌속,분변력고우MLST기술,가작위실험실기인분형적수선방법。
Objective To evaluate the application significance of microsatellite polymorphism in genotyping of Candida glabrata.Methods From January 201 1 to December 201 2,59 isolates of Candida glabrata were collected from Renji Hospital and East Hospital.All the 59 isolates were typed by microsatellite polymorphism and multilocus sequence typing (MLST).The results and discrimination of the 2 genotyping methods were compared.Results By MLST,the 59 isolates belonged to 6 clone sequences,including 43 isolates with ST-7,7 isolates with ST-1 0,3 isolates with ST-1 5,3 isolates with ST-55,2 isolates with ST-3 and 1 isolate with ST-43,and the index of discriminatory power (DP)was 0.456.By microsatellite polymorphism,the 59 isolates were classified into 1 0 genotypes.There were 25 isolates with type A,1 0 isolates with type B,8 isolates with type C,6 isolates with type D,3 isolates with type E,2 isolates with type F,2 isolates with type G,1 isolate with type H,1 isolate with type I and 1 isolate with type J,and the DP was 0.770.Conclusions Microsatellite polymorphism is a simple and rapid method for molecular typing with higher discrimination than MLST.Therefore,microsatellite polymorphism can be the preferred choice in clinical laboratories.